Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM248Q9NWD8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM248Q9NWD8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM248Q9NWD8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM248Q9NWD8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM248Q9NWD8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM248Q9NWD8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM248Q9NWD8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM248Q9NWD8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM248Q9NWD8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM248Q9NWD8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM248Q9NWD8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM248Q9NWD8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM248Q9NWD8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM248Q9NWD8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM248Q9NWD8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM248Q9NWD8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM248Q9NWD8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM248Q9NWD8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM248Q9NWD8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM248Q9NWD8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM248Q9NWD8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM248Q9NWD8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM248Q9NWD8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM248Q9NWD8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM248Q9NWD8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM248Q9NWD8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM248Q9NWD8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM248Q9NWD8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM248Q9NWD8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM248Q9NWD8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM248Q9NWD8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM248Q9NWD8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM248Q9NWD8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM248Q9NWD8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM248Q9NWD8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM248Q9NWD8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM248Q9NWD8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM248Q9NWD8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM248Q9NWD8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM248Q9NWD8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM248Q9NWD8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM248Q9NWD8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM248Q9NWD8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM248Q9NWD8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM248Q9NWD8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM248Q9NWD8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM248Q9NWD8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMEM248Q9NWD8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMEM248Q9NWD8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM248Q9NWD8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM248Q9NWD8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM248Q9NWD8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM248Q9NWD8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM248Q9NWD8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM248Q9NWD8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM248Q9NWD8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM248Q9NWD8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM248Q9NWD8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM248Q9NWD8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM248Q9NWD8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM248Q9NWD8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM248Q9NWD8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM248Q9NWD8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM248Q9NWD8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM248Q9NWD8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM248Q9NWD8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM248Q9NWD8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM248Q9NWD8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM248Q9NWD8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM248Q9NWD8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM248Q9NWD8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM248Q9NWD8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM248Q9NWD8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM248Q9NWD8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM248Q9NWD8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM248Q9NWD8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM248Q9NWD8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM248Q9NWD8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM248Q9NWD8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM248Q9NWD8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM248Q9NWD8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM248Q9NWD8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM248Q9NWD8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM248Q9NWD8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM248Q9NWD8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM248Q9NWD8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM248Q9NWD8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM248Q9NWD8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM248Q9NWD8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM248Q9NWD8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM248Q9NWD8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM248Q9NWD8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM248Q9NWD8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM248Q9NWD8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM248Q9NWD8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM248Q9NWD8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM248Q9NWD8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM248Q9NWD8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM248Q9NWD8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms