Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW3

APOBEC3C, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3C, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3CQ9NRW3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.142e-7■■■■□ 23.6
APOBEC3CQ9NRW3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.121e-12■■■■□ 23.5
APOBEC3CQ9NRW3 CALU-201ENST00000249364 3357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.391e-12■■■■□ 23.5
APOBEC3CQ9NRW3 CALU-206ENST00000542996 4225 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.841e-12■■■■□ 23.5
APOBEC3CQ9NRW3 CALU-204ENST00000493278 589 ntTSL 35.29□□□□□ -1.561e-12■■■■□ 23.5
APOBEC3CQ9NRW3 PET100-207ENST00000623154 1815 nt24.41■■□□□ 1.53e-7■■■■□ 23.5
APOBEC3CQ9NRW3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.213e-7■■■■□ 23.5
APOBEC3CQ9NRW3 AC008763.2-202ENST00000599243 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 420.99■□□□□ 0.953e-7■■■■□ 23.5
APOBEC3CQ9NRW3 AC008763.2-201ENST00000598664 537 ntAPPRIS P5 TSL 516.88■□□□□ 0.293e-7■■■■□ 23.5
APOBEC3CQ9NRW3 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.113e-7■■■■□ 23.5
APOBEC3CQ9NRW3 PET100-204ENST00000600836 474 ntTSL 314.54□□□□□ -0.083e-7■■■■□ 23.5
APOBEC3CQ9NRW3 PET100-206ENST00000601829 317 ntTSL 213.11□□□□□ -0.313e-7■■■■□ 23.5
APOBEC3CQ9NRW3 PET100-205ENST00000601406 332 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.53e-7■■■■□ 23.5
APOBEC3CQ9NRW3 PET100-201ENST00000456958 219 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.883e-7■■■■□ 23.5
APOBEC3CQ9NRW3 PET100-203ENST00000598540 375 ntTSL 35.82□□□□□ -1.483e-7■■■■□ 23.5
APOBEC3CQ9NRW3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.065e-7■■■■□ 23.4
APOBEC3CQ9NRW3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.565e-7■■■■□ 23.4
APOBEC3CQ9NRW3 PTTG1-201ENST00000352433 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.975e-7■■■■□ 23.4
APOBEC3CQ9NRW3 PTTG1-204ENST00000519287 670 ntTSL 58.23□□□□□ -1.095e-7■■■■□ 23.4
APOBEC3CQ9NRW3 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.96■□□□□ 0.151e-10■■■■□ 23.4
APOBEC3CQ9NRW3 NUP205-209ENST00000491089 553 ntTSL 28.93□□□□□ -0.981e-10■■■■□ 23.4
APOBEC3CQ9NRW3 NUP205-208ENST00000490439 653 ntTSL 38.38□□□□□ -1.071e-10■■■■□ 23.4
APOBEC3CQ9NRW3 NUP205-202ENST00000461255 1447 ntTSL 58.06□□□□□ -1.121e-10■■■■□ 23.4
APOBEC3CQ9NRW3 NUP205-210ENST00000607647 4518 ntTSL 55.88□□□□□ -1.471e-10■■■■□ 23.4
APOBEC3CQ9NRW3 NUP205-206ENST00000477620 1800 ntTSL 54.91□□□□□ -1.621e-10■■■■□ 23.4
APOBEC3CQ9NRW3 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.661e-10■■■■□ 23.4
APOBEC3CQ9NRW3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.291e-14■■■■□ 23.4
APOBEC3CQ9NRW3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.61e-14■■■■□ 23.4
APOBEC3CQ9NRW3 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.021e-14■■■■□ 23.4
APOBEC3CQ9NRW3 CHTF8-201ENST00000306585 2561 ntBASIC11.38□□□□□ -0.591e-14■■■■□ 23.4
APOBEC3CQ9NRW3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.342e-6■■■■□ 23.3
APOBEC3CQ9NRW3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.812e-10■■■■□ 23.2
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFB8-209ENST00000531418 585 ntTSL 319.32■□□□□ 0.682e-10■■■■□ 23.2
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFB8-207ENST00000529437 602 ntTSL 218.76■□□□□ 0.592e-10■■■■□ 23.2
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.362e-10■■■■□ 23.2
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFB8-206ENST00000528425 608 ntTSL 417.08■□□□□ 0.322e-10■■■■□ 23.2
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFB8-205ENST00000466088 829 ntTSL 216.88■□□□□ 0.292e-10■■■■□ 23.2
APOBEC3CQ9NRW3 AL133352.1-202ENST00000527595 1423 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.16■□□□□ 0.182e-10■■■■□ 23.2
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.092e-10■■■■□ 23.2
APOBEC3CQ9NRW3 AL133352.1-201ENST00000529568 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 214.88□□□□□ -0.032e-10■■■■□ 23.2
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFB8-203ENST00000370322 713 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.272e-10■■■■□ 23.2
APOBEC3CQ9NRW3 AL133352.1-205ENST00000533549 582 ntAPPRIS ALT2 TSL 413.03□□□□□ -0.322e-10■■■■□ 23.2
APOBEC3CQ9NRW3 AL133352.1-204ENST00000528174 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 310.48□□□□□ -0.732e-10■■■■□ 23.2
APOBEC3CQ9NRW3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.485e-11■■■■□ 23.1
APOBEC3CQ9NRW3 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.185e-11■■■■□ 23.1
APOBEC3CQ9NRW3 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.25e-11■■■■□ 23.1
APOBEC3CQ9NRW3 CLIC1-207ENST00000375780 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.335e-11■■■■□ 23.1
APOBEC3CQ9NRW3 CLIC1-210ENST00000616760 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.715e-11■■■■□ 23.1
APOBEC3CQ9NRW3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.261e-20■■■■□ 22.8
APOBEC3CQ9NRW3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.211e-20■■■■□ 22.8
APOBEC3CQ9NRW3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.11e-20■■■■□ 22.8
APOBEC3CQ9NRW3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.431e-6■■■■□ 22.8
APOBEC3CQ9NRW3 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.151e-6■■■■□ 22.8
APOBEC3CQ9NRW3 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.281e-6■■■■□ 22.8
APOBEC3CQ9NRW3 SNRPF-202ENST00000549580 757 ntTSL 23.18□□□□□ -1.91e-6■■■■□ 22.8
APOBEC3CQ9NRW3 CYBA-205ENST00000565588 221 ntTSL 211.95□□□□□ -0.52e-7■■■■□ 22.7
APOBEC3CQ9NRW3 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.424e-10■■■■□ 22.6
APOBEC3CQ9NRW3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.131e-14■■■■□ 22.6
APOBEC3CQ9NRW3 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.024e-10■■■■□ 22.6
APOBEC3CQ9NRW3 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.024e-10■■■■□ 22.6
APOBEC3CQ9NRW3 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.134e-10■■■■□ 22.6
APOBEC3CQ9NRW3 RNF187-202ENST00000482739 2467 ntTSL 513.5□□□□□ -0.251e-14■■■■□ 22.6
APOBEC3CQ9NRW3 SAT1-209ENST00000489394 1135 ntTSL 212.28□□□□□ -0.444e-10■■■■□ 22.6
APOBEC3CQ9NRW3 CCNB1-203ENST00000505500 1190 ntTSL 1 (best)8.2□□□□□ -1.14e-10■■■■□ 22.6
APOBEC3CQ9NRW3 SAT1-206ENST00000463236 735 ntTSL 36.63□□□□□ -1.354e-10■■■■□ 22.6
APOBEC3CQ9NRW3 SAT1-207ENST00000474223 1033 ntTSL 26.57□□□□□ -1.364e-10■■■■□ 22.6
APOBEC3CQ9NRW3 CCNB1-205ENST00000507798 767 ntTSL 34.15□□□□□ -1.754e-10■■■■□ 22.6
APOBEC3CQ9NRW3 SAT1-205ENST00000462639 826 ntTSL 22.44□□□□□ -2.024e-10■■■■□ 22.6
APOBEC3CQ9NRW3 CCNB1-207ENST00000513102 463 ntTSL 21.97□□□□□ -2.094e-10■■■■□ 22.6
APOBEC3CQ9NRW3 STARD4-212ENST00000512160 3500 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.096e-6■■■■□ 22.5
APOBEC3CQ9NRW3 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.766e-6■■■■□ 22.5
APOBEC3CQ9NRW3 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.082e-6■■■■□ 22.4
APOBEC3CQ9NRW3 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.292e-6■■■■□ 22.4
APOBEC3CQ9NRW3 RANBP1-203ENST00000411892 584 ntTSL 216.08■□□□□ 0.169e-8■■■■□ 22.2
APOBEC3CQ9NRW3 RPS8-207ENST00000485390 1115 ntTSL 1 (best)23.28■■□□□ 1.329e-10■■■■□ 21.8
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFA3-213ENST00000484103 541 ntTSL 1 (best)21.1■□□□□ 0.979e-10■■■■□ 21.8
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.549e-10■■■■□ 21.8
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFA3-206ENST00000419113 654 ntTSL 317.58■□□□□ 0.49e-10■■■■□ 21.8
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.399e-10■■■■□ 21.8
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFA3-205ENST00000417903 666 ntTSL 316.52■□□□□ 0.249e-10■■■■□ 21.8
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.239e-10■■■■□ 21.8
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.259e-10■■■■□ 21.8
APOBEC3CQ9NRW3 RPS8-202ENST00000396651 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.379e-10■■■■□ 21.8
APOBEC3CQ9NRW3 RPS8-205ENST00000474582 391 ntTSL 1 (best)12.73□□□□□ -0.379e-10■■■■□ 21.8
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFA3-208ENST00000422029 694 ntTSL 312.46□□□□□ -0.419e-10■■■■□ 21.8
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFA3-209ENST00000451517 445 ntTSL 1 (best)11.71□□□□□ -0.539e-10■■■■□ 21.8
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFA3-210ENST00000471292 646 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.539e-10■■■■□ 21.8
APOBEC3CQ9NRW3 RPS8-201ENST00000372209 685 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.559e-10■■■■□ 21.8
APOBEC3CQ9NRW3 RPS8-203ENST00000464658 898 ntTSL 210.17□□□□□ -0.789e-10■■■■□ 21.8
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFA3-202ENST00000391762 435 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.819e-10■■■■□ 21.8
APOBEC3CQ9NRW3 TRA2A-206ENST00000482395 661 ntTSL 222.76■■□□□ 1.237e-16■■■■□ 21.8
APOBEC3CQ9NRW3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.477e-16■■■■□ 21.8
APOBEC3CQ9NRW3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.367e-16■■■■□ 21.8
APOBEC3CQ9NRW3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.157e-16■■■■□ 21.8
APOBEC3CQ9NRW3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 07e-16■■■■□ 21.8
APOBEC3CQ9NRW3 TRA2A-210ENST00000497730 455 ntTSL 34.35□□□□□ -1.717e-16■■■■□ 21.8
APOBEC3CQ9NRW3 TRA2A-207ENST00000486934 417 ntTSL 23.55□□□□□ -1.847e-16■■■■□ 21.8
APOBEC3CQ9NRW3 TRA2A-205ENST00000475970 394 ntTSL 22.81□□□□□ -1.967e-16■■■■□ 21.8
APOBEC3CQ9NRW3 CYC1-204ENST00000533444 1832 ntTSL 1 (best)26.98■■□□□ 1.918e-8■■■■□ 21.6
APOBEC3CQ9NRW3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.448e-8■■■■□ 21.6
Retrieved 100 of 4,302 protein–RNA pairs in 314.7 ms