Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAPOLBQ9NRJ5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAPOLBQ9NRJ5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAPOLBQ9NRJ5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PAPOLBQ9NRJ5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PAPOLBQ9NRJ5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAPOLBQ9NRJ5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAPOLBQ9NRJ5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAPOLBQ9NRJ5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAPOLBQ9NRJ5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAPOLBQ9NRJ5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAPOLBQ9NRJ5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAPOLBQ9NRJ5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAPOLBQ9NRJ5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAPOLBQ9NRJ5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAPOLBQ9NRJ5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAPOLBQ9NRJ5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAPOLBQ9NRJ5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAPOLBQ9NRJ5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAPOLBQ9NRJ5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAPOLBQ9NRJ5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PAPOLBQ9NRJ5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAPOLBQ9NRJ5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAPOLBQ9NRJ5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAPOLBQ9NRJ5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAPOLBQ9NRJ5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAPOLBQ9NRJ5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAPOLBQ9NRJ5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PAPOLBQ9NRJ5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PAPOLBQ9NRJ5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAPOLBQ9NRJ5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAPOLBQ9NRJ5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAPOLBQ9NRJ5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAPOLBQ9NRJ5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAPOLBQ9NRJ5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAPOLBQ9NRJ5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAPOLBQ9NRJ5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAPOLBQ9NRJ5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAPOLBQ9NRJ5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAPOLBQ9NRJ5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAPOLBQ9NRJ5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAPOLBQ9NRJ5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAPOLBQ9NRJ5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAPOLBQ9NRJ5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAPOLBQ9NRJ5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PAPOLBQ9NRJ5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PAPOLBQ9NRJ5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAPOLBQ9NRJ5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAPOLBQ9NRJ5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAPOLBQ9NRJ5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAPOLBQ9NRJ5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PAPOLBQ9NRJ5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAPOLBQ9NRJ5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAPOLBQ9NRJ5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAPOLBQ9NRJ5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAPOLBQ9NRJ5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAPOLBQ9NRJ5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAPOLBQ9NRJ5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PAPOLBQ9NRJ5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PAPOLBQ9NRJ5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PAPOLBQ9NRJ5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PAPOLBQ9NRJ5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PAPOLBQ9NRJ5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PAPOLBQ9NRJ5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PAPOLBQ9NRJ5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PAPOLBQ9NRJ5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PAPOLBQ9NRJ5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAPOLBQ9NRJ5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAPOLBQ9NRJ5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAPOLBQ9NRJ5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAPOLBQ9NRJ5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAPOLBQ9NRJ5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAPOLBQ9NRJ5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAPOLBQ9NRJ5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAPOLBQ9NRJ5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAPOLBQ9NRJ5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAPOLBQ9NRJ5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAPOLBQ9NRJ5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAPOLBQ9NRJ5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAPOLBQ9NRJ5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAPOLBQ9NRJ5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAPOLBQ9NRJ5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAPOLBQ9NRJ5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAPOLBQ9NRJ5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAPOLBQ9NRJ5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAPOLBQ9NRJ5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAPOLBQ9NRJ5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAPOLBQ9NRJ5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAPOLBQ9NRJ5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAPOLBQ9NRJ5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAPOLBQ9NRJ5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAPOLBQ9NRJ5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAPOLBQ9NRJ5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAPOLBQ9NRJ5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAPOLBQ9NRJ5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAPOLBQ9NRJ5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAPOLBQ9NRJ5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAPOLBQ9NRJ5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAPOLBQ9NRJ5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms