Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6E4

CCDC134, Coiled-coil domain-containing protein 134, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC134Q9H6E4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC134Q9H6E4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC134Q9H6E4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC134Q9H6E4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC134Q9H6E4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC134Q9H6E4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC134Q9H6E4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC134Q9H6E4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC134Q9H6E4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC134Q9H6E4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC134Q9H6E4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC134Q9H6E4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC134Q9H6E4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC134Q9H6E4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC134Q9H6E4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC134Q9H6E4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC134Q9H6E4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC134Q9H6E4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC134Q9H6E4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC134Q9H6E4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC134Q9H6E4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC134Q9H6E4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC134Q9H6E4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC134Q9H6E4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC134Q9H6E4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC134Q9H6E4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC134Q9H6E4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC134Q9H6E4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC134Q9H6E4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC134Q9H6E4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC134Q9H6E4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC134Q9H6E4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC134Q9H6E4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC134Q9H6E4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC134Q9H6E4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC134Q9H6E4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC134Q9H6E4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC134Q9H6E4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC134Q9H6E4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC134Q9H6E4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC134Q9H6E4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC134Q9H6E4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC134Q9H6E4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC134Q9H6E4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC134Q9H6E4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC134Q9H6E4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC134Q9H6E4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC134Q9H6E4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC134Q9H6E4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC134Q9H6E4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC134Q9H6E4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC134Q9H6E4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC134Q9H6E4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC134Q9H6E4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC134Q9H6E4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC134Q9H6E4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC134Q9H6E4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC134Q9H6E4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC134Q9H6E4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC134Q9H6E4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC134Q9H6E4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC134Q9H6E4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC134Q9H6E4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC134Q9H6E4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC134Q9H6E4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC134Q9H6E4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC134Q9H6E4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC134Q9H6E4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC134Q9H6E4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC134Q9H6E4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC134Q9H6E4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC134Q9H6E4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC134Q9H6E4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC134Q9H6E4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC134Q9H6E4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC134Q9H6E4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC134Q9H6E4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC134Q9H6E4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC134Q9H6E4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC134Q9H6E4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC134Q9H6E4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC134Q9H6E4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC134Q9H6E4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC134Q9H6E4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC134Q9H6E4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC134Q9H6E4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC134Q9H6E4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC134Q9H6E4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC134Q9H6E4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC134Q9H6E4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC134Q9H6E4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC134Q9H6E4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC134Q9H6E4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC134Q9H6E4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC134Q9H6E4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC134Q9H6E4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC134Q9H6E4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC134Q9H6E4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC134Q9H6E4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC134Q9H6E4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms