Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0C1

ZMYND12, Zinc finger MYND domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND12Q9H0C1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZMYND12Q9H0C1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ZMYND12Q9H0C1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZMYND12Q9H0C1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZMYND12Q9H0C1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
ZMYND12Q9H0C1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZMYND12Q9H0C1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZMYND12Q9H0C1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZMYND12Q9H0C1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZMYND12Q9H0C1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZMYND12Q9H0C1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZMYND12Q9H0C1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZMYND12Q9H0C1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ZMYND12Q9H0C1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ZMYND12Q9H0C1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZMYND12Q9H0C1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZMYND12Q9H0C1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZMYND12Q9H0C1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZMYND12Q9H0C1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZMYND12Q9H0C1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZMYND12Q9H0C1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZMYND12Q9H0C1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
ZMYND12Q9H0C1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZMYND12Q9H0C1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZMYND12Q9H0C1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZMYND12Q9H0C1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
ZMYND12Q9H0C1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZMYND12Q9H0C1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZMYND12Q9H0C1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZMYND12Q9H0C1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZMYND12Q9H0C1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZMYND12Q9H0C1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
ZMYND12Q9H0C1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZMYND12Q9H0C1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZMYND12Q9H0C1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZMYND12Q9H0C1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZMYND12Q9H0C1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ZMYND12Q9H0C1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZMYND12Q9H0C1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZMYND12Q9H0C1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZMYND12Q9H0C1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZMYND12Q9H0C1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZMYND12Q9H0C1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZMYND12Q9H0C1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZMYND12Q9H0C1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZMYND12Q9H0C1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZMYND12Q9H0C1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZMYND12Q9H0C1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZMYND12Q9H0C1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZMYND12Q9H0C1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZMYND12Q9H0C1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZMYND12Q9H0C1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZMYND12Q9H0C1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZMYND12Q9H0C1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZMYND12Q9H0C1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZMYND12Q9H0C1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZMYND12Q9H0C1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZMYND12Q9H0C1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZMYND12Q9H0C1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZMYND12Q9H0C1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZMYND12Q9H0C1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZMYND12Q9H0C1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZMYND12Q9H0C1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZMYND12Q9H0C1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZMYND12Q9H0C1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZMYND12Q9H0C1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZMYND12Q9H0C1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZMYND12Q9H0C1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZMYND12Q9H0C1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZMYND12Q9H0C1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZMYND12Q9H0C1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZMYND12Q9H0C1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZMYND12Q9H0C1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZMYND12Q9H0C1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZMYND12Q9H0C1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ZMYND12Q9H0C1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZMYND12Q9H0C1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZMYND12Q9H0C1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
ZMYND12Q9H0C1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZMYND12Q9H0C1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZMYND12Q9H0C1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZMYND12Q9H0C1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZMYND12Q9H0C1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZMYND12Q9H0C1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZMYND12Q9H0C1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZMYND12Q9H0C1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZMYND12Q9H0C1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZMYND12Q9H0C1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZMYND12Q9H0C1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZMYND12Q9H0C1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
ZMYND12Q9H0C1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZMYND12Q9H0C1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZMYND12Q9H0C1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
ZMYND12Q9H0C1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZMYND12Q9H0C1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZMYND12Q9H0C1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
ZMYND12Q9H0C1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZMYND12Q9H0C1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZMYND12Q9H0C1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZMYND12Q9H0C1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms