Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PDGFDQ9GZP0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PDGFDQ9GZP0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PDGFDQ9GZP0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PDGFDQ9GZP0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
PDGFDQ9GZP0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PDGFDQ9GZP0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PDGFDQ9GZP0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PDGFDQ9GZP0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PDGFDQ9GZP0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PDGFDQ9GZP0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PDGFDQ9GZP0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PDGFDQ9GZP0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PDGFDQ9GZP0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PDGFDQ9GZP0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PDGFDQ9GZP0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
PDGFDQ9GZP0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PDGFDQ9GZP0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PDGFDQ9GZP0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PDGFDQ9GZP0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
PDGFDQ9GZP0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PDGFDQ9GZP0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PDGFDQ9GZP0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PDGFDQ9GZP0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PDGFDQ9GZP0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PDGFDQ9GZP0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PDGFDQ9GZP0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PDGFDQ9GZP0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PDGFDQ9GZP0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PDGFDQ9GZP0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PDGFDQ9GZP0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PDGFDQ9GZP0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PDGFDQ9GZP0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PDGFDQ9GZP0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PDGFDQ9GZP0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
PDGFDQ9GZP0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
PDGFDQ9GZP0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
PDGFDQ9GZP0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PDGFDQ9GZP0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PDGFDQ9GZP0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PDGFDQ9GZP0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PDGFDQ9GZP0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PDGFDQ9GZP0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PDGFDQ9GZP0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PDGFDQ9GZP0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PDGFDQ9GZP0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PDGFDQ9GZP0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PDGFDQ9GZP0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PDGFDQ9GZP0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PDGFDQ9GZP0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PDGFDQ9GZP0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PDGFDQ9GZP0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PDGFDQ9GZP0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PDGFDQ9GZP0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PDGFDQ9GZP0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PDGFDQ9GZP0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
PDGFDQ9GZP0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PDGFDQ9GZP0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PDGFDQ9GZP0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PDGFDQ9GZP0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PDGFDQ9GZP0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PDGFDQ9GZP0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PDGFDQ9GZP0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
PDGFDQ9GZP0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PDGFDQ9GZP0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PDGFDQ9GZP0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PDGFDQ9GZP0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PDGFDQ9GZP0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
PDGFDQ9GZP0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PDGFDQ9GZP0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PDGFDQ9GZP0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PDGFDQ9GZP0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PDGFDQ9GZP0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PDGFDQ9GZP0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PDGFDQ9GZP0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PDGFDQ9GZP0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PDGFDQ9GZP0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
PDGFDQ9GZP0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PDGFDQ9GZP0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
PDGFDQ9GZP0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PDGFDQ9GZP0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PDGFDQ9GZP0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PDGFDQ9GZP0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PDGFDQ9GZP0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PDGFDQ9GZP0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
PDGFDQ9GZP0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
PDGFDQ9GZP0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PDGFDQ9GZP0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PDGFDQ9GZP0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PDGFDQ9GZP0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
PDGFDQ9GZP0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
PDGFDQ9GZP0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PDGFDQ9GZP0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PDGFDQ9GZP0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PDGFDQ9GZP0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PDGFDQ9GZP0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PDGFDQ9GZP0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PDGFDQ9GZP0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PDGFDQ9GZP0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PDGFDQ9GZP0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms