Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW5

TIPIN, TIMELESS-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIPINQ9BVW5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TIPINQ9BVW5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TIPINQ9BVW5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TIPINQ9BVW5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TIPINQ9BVW5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TIPINQ9BVW5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TIPINQ9BVW5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TIPINQ9BVW5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TIPINQ9BVW5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TIPINQ9BVW5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TIPINQ9BVW5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TIPINQ9BVW5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TIPINQ9BVW5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TIPINQ9BVW5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TIPINQ9BVW5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TIPINQ9BVW5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TIPINQ9BVW5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TIPINQ9BVW5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TIPINQ9BVW5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TIPINQ9BVW5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TIPINQ9BVW5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TIPINQ9BVW5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TIPINQ9BVW5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TIPINQ9BVW5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TIPINQ9BVW5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TIPINQ9BVW5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TIPINQ9BVW5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TIPINQ9BVW5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TIPINQ9BVW5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TIPINQ9BVW5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TIPINQ9BVW5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TIPINQ9BVW5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TIPINQ9BVW5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TIPINQ9BVW5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TIPINQ9BVW5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TIPINQ9BVW5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TIPINQ9BVW5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TIPINQ9BVW5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TIPINQ9BVW5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TIPINQ9BVW5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TIPINQ9BVW5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TIPINQ9BVW5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TIPINQ9BVW5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TIPINQ9BVW5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TIPINQ9BVW5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TIPINQ9BVW5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TIPINQ9BVW5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TIPINQ9BVW5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TIPINQ9BVW5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TIPINQ9BVW5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TIPINQ9BVW5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TIPINQ9BVW5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TIPINQ9BVW5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TIPINQ9BVW5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TIPINQ9BVW5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TIPINQ9BVW5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TIPINQ9BVW5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TIPINQ9BVW5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TIPINQ9BVW5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TIPINQ9BVW5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TIPINQ9BVW5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TIPINQ9BVW5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TIPINQ9BVW5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TIPINQ9BVW5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TIPINQ9BVW5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TIPINQ9BVW5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TIPINQ9BVW5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TIPINQ9BVW5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TIPINQ9BVW5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TIPINQ9BVW5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TIPINQ9BVW5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TIPINQ9BVW5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TIPINQ9BVW5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TIPINQ9BVW5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TIPINQ9BVW5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TIPINQ9BVW5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TIPINQ9BVW5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TIPINQ9BVW5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TIPINQ9BVW5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TIPINQ9BVW5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TIPINQ9BVW5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TIPINQ9BVW5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TIPINQ9BVW5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TIPINQ9BVW5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TIPINQ9BVW5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TIPINQ9BVW5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TIPINQ9BVW5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TIPINQ9BVW5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TIPINQ9BVW5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TIPINQ9BVW5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TIPINQ9BVW5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TIPINQ9BVW5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TIPINQ9BVW5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TIPINQ9BVW5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TIPINQ9BVW5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TIPINQ9BVW5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TIPINQ9BVW5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TIPINQ9BVW5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TIPINQ9BVW5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TIPINQ9BVW5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms