Protein–RNA interactions for Protein: Q96RU3

FNBP1, Formin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNBP1Q96RU3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FNBP1Q96RU3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
FNBP1Q96RU3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FNBP1Q96RU3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FNBP1Q96RU3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FNBP1Q96RU3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
FNBP1Q96RU3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FNBP1Q96RU3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FNBP1Q96RU3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FNBP1Q96RU3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FNBP1Q96RU3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FNBP1Q96RU3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FNBP1Q96RU3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FNBP1Q96RU3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FNBP1Q96RU3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FNBP1Q96RU3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FNBP1Q96RU3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FNBP1Q96RU3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FNBP1Q96RU3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FNBP1Q96RU3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FNBP1Q96RU3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FNBP1Q96RU3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FNBP1Q96RU3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FNBP1Q96RU3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FNBP1Q96RU3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FNBP1Q96RU3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
FNBP1Q96RU3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FNBP1Q96RU3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FNBP1Q96RU3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FNBP1Q96RU3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FNBP1Q96RU3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FNBP1Q96RU3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FNBP1Q96RU3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
FNBP1Q96RU3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FNBP1Q96RU3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FNBP1Q96RU3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FNBP1Q96RU3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FNBP1Q96RU3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FNBP1Q96RU3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FNBP1Q96RU3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FNBP1Q96RU3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FNBP1Q96RU3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FNBP1Q96RU3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FNBP1Q96RU3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FNBP1Q96RU3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FNBP1Q96RU3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FNBP1Q96RU3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FNBP1Q96RU3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FNBP1Q96RU3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
FNBP1Q96RU3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FNBP1Q96RU3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FNBP1Q96RU3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FNBP1Q96RU3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FNBP1Q96RU3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FNBP1Q96RU3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FNBP1Q96RU3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FNBP1Q96RU3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FNBP1Q96RU3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FNBP1Q96RU3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FNBP1Q96RU3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FNBP1Q96RU3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FNBP1Q96RU3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FNBP1Q96RU3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FNBP1Q96RU3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FNBP1Q96RU3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FNBP1Q96RU3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FNBP1Q96RU3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FNBP1Q96RU3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FNBP1Q96RU3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FNBP1Q96RU3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FNBP1Q96RU3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FNBP1Q96RU3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FNBP1Q96RU3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FNBP1Q96RU3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FNBP1Q96RU3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FNBP1Q96RU3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FNBP1Q96RU3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FNBP1Q96RU3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FNBP1Q96RU3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FNBP1Q96RU3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FNBP1Q96RU3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FNBP1Q96RU3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FNBP1Q96RU3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FNBP1Q96RU3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FNBP1Q96RU3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FNBP1Q96RU3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FNBP1Q96RU3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FNBP1Q96RU3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FNBP1Q96RU3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FNBP1Q96RU3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FNBP1Q96RU3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FNBP1Q96RU3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
FNBP1Q96RU3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FNBP1Q96RU3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FNBP1Q96RU3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FNBP1Q96RU3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FNBP1Q96RU3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FNBP1Q96RU3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FNBP1Q96RU3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FNBP1Q96RU3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms