Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS50Q96JG6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS50Q96JG6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS50Q96JG6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS50Q96JG6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS50Q96JG6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS50Q96JG6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS50Q96JG6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS50Q96JG6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS50Q96JG6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS50Q96JG6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS50Q96JG6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS50Q96JG6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS50Q96JG6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS50Q96JG6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS50Q96JG6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS50Q96JG6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS50Q96JG6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS50Q96JG6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS50Q96JG6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS50Q96JG6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS50Q96JG6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS50Q96JG6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS50Q96JG6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS50Q96JG6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS50Q96JG6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS50Q96JG6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS50Q96JG6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS50Q96JG6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS50Q96JG6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS50Q96JG6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS50Q96JG6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS50Q96JG6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS50Q96JG6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS50Q96JG6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS50Q96JG6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS50Q96JG6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS50Q96JG6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS50Q96JG6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS50Q96JG6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS50Q96JG6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS50Q96JG6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS50Q96JG6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS50Q96JG6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS50Q96JG6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS50Q96JG6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS50Q96JG6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS50Q96JG6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS50Q96JG6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS50Q96JG6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS50Q96JG6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS50Q96JG6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS50Q96JG6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS50Q96JG6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS50Q96JG6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS50Q96JG6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS50Q96JG6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS50Q96JG6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS50Q96JG6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS50Q96JG6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS50Q96JG6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS50Q96JG6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS50Q96JG6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS50Q96JG6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS50Q96JG6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS50Q96JG6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS50Q96JG6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS50Q96JG6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS50Q96JG6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS50Q96JG6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS50Q96JG6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS50Q96JG6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS50Q96JG6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS50Q96JG6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS50Q96JG6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS50Q96JG6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS50Q96JG6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS50Q96JG6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS50Q96JG6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS50Q96JG6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS50Q96JG6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS50Q96JG6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS50Q96JG6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS50Q96JG6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS50Q96JG6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS50Q96JG6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS50Q96JG6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS50Q96JG6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS50Q96JG6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS50Q96JG6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS50Q96JG6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS50Q96JG6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS50Q96JG6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS50Q96JG6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS50Q96JG6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS50Q96JG6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS50Q96JG6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS50Q96JG6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS50Q96JG6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS50Q96JG6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms