Protein–RNA interactions for Protein: Q96IY1

NSL1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSL1Q96IY1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NSL1Q96IY1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NSL1Q96IY1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NSL1Q96IY1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NSL1Q96IY1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NSL1Q96IY1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NSL1Q96IY1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NSL1Q96IY1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NSL1Q96IY1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NSL1Q96IY1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NSL1Q96IY1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NSL1Q96IY1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NSL1Q96IY1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NSL1Q96IY1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NSL1Q96IY1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NSL1Q96IY1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NSL1Q96IY1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NSL1Q96IY1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NSL1Q96IY1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NSL1Q96IY1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NSL1Q96IY1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NSL1Q96IY1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NSL1Q96IY1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NSL1Q96IY1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NSL1Q96IY1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NSL1Q96IY1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NSL1Q96IY1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NSL1Q96IY1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NSL1Q96IY1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NSL1Q96IY1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NSL1Q96IY1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NSL1Q96IY1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSL1Q96IY1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSL1Q96IY1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSL1Q96IY1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSL1Q96IY1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSL1Q96IY1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSL1Q96IY1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSL1Q96IY1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSL1Q96IY1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NSL1Q96IY1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NSL1Q96IY1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NSL1Q96IY1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NSL1Q96IY1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NSL1Q96IY1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSL1Q96IY1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSL1Q96IY1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSL1Q96IY1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSL1Q96IY1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSL1Q96IY1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSL1Q96IY1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSL1Q96IY1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSL1Q96IY1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSL1Q96IY1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSL1Q96IY1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSL1Q96IY1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NSL1Q96IY1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NSL1Q96IY1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NSL1Q96IY1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NSL1Q96IY1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSL1Q96IY1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSL1Q96IY1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSL1Q96IY1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSL1Q96IY1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSL1Q96IY1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSL1Q96IY1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSL1Q96IY1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSL1Q96IY1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSL1Q96IY1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSL1Q96IY1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSL1Q96IY1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSL1Q96IY1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSL1Q96IY1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NSL1Q96IY1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSL1Q96IY1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSL1Q96IY1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSL1Q96IY1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSL1Q96IY1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSL1Q96IY1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSL1Q96IY1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSL1Q96IY1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSL1Q96IY1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSL1Q96IY1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSL1Q96IY1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSL1Q96IY1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSL1Q96IY1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSL1Q96IY1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSL1Q96IY1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSL1Q96IY1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NSL1Q96IY1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSL1Q96IY1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSL1Q96IY1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSL1Q96IY1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSL1Q96IY1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSL1Q96IY1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSL1Q96IY1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSL1Q96IY1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSL1Q96IY1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSL1Q96IY1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSL1Q96IY1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms