Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXOSC8Q96B26 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXOSC8Q96B26 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXOSC8Q96B26 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXOSC8Q96B26 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXOSC8Q96B26 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXOSC8Q96B26 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXOSC8Q96B26 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXOSC8Q96B26 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXOSC8Q96B26 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXOSC8Q96B26 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXOSC8Q96B26 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXOSC8Q96B26 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXOSC8Q96B26 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
EXOSC8Q96B26 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXOSC8Q96B26 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXOSC8Q96B26 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXOSC8Q96B26 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXOSC8Q96B26 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXOSC8Q96B26 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXOSC8Q96B26 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXOSC8Q96B26 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXOSC8Q96B26 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXOSC8Q96B26 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXOSC8Q96B26 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXOSC8Q96B26 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXOSC8Q96B26 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC8Q96B26 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC8Q96B26 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC8Q96B26 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC8Q96B26 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC8Q96B26 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXOSC8Q96B26 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXOSC8Q96B26 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXOSC8Q96B26 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXOSC8Q96B26 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXOSC8Q96B26 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXOSC8Q96B26 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXOSC8Q96B26 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXOSC8Q96B26 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXOSC8Q96B26 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXOSC8Q96B26 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXOSC8Q96B26 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXOSC8Q96B26 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXOSC8Q96B26 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXOSC8Q96B26 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXOSC8Q96B26 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXOSC8Q96B26 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXOSC8Q96B26 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXOSC8Q96B26 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXOSC8Q96B26 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXOSC8Q96B26 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXOSC8Q96B26 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXOSC8Q96B26 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXOSC8Q96B26 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EXOSC8Q96B26 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXOSC8Q96B26 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXOSC8Q96B26 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXOSC8Q96B26 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXOSC8Q96B26 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXOSC8Q96B26 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXOSC8Q96B26 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXOSC8Q96B26 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXOSC8Q96B26 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EXOSC8Q96B26 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EXOSC8Q96B26 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EXOSC8Q96B26 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EXOSC8Q96B26 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXOSC8Q96B26 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
EXOSC8Q96B26 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXOSC8Q96B26 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXOSC8Q96B26 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXOSC8Q96B26 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXOSC8Q96B26 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC8Q96B26 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC8Q96B26 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC8Q96B26 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC8Q96B26 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC8Q96B26 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC8Q96B26 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC8Q96B26 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EXOSC8Q96B26 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EXOSC8Q96B26 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EXOSC8Q96B26 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXOSC8Q96B26 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXOSC8Q96B26 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXOSC8Q96B26 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXOSC8Q96B26 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXOSC8Q96B26 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXOSC8Q96B26 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXOSC8Q96B26 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXOSC8Q96B26 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXOSC8Q96B26 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXOSC8Q96B26 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXOSC8Q96B26 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXOSC8Q96B26 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXOSC8Q96B26 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXOSC8Q96B26 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXOSC8Q96B26 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXOSC8Q96B26 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms