Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
FRAT1Q92837 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.77■■■■□ 3
FRAT1Q92837 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
FRAT1Q92837 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■■□ 3
FRAT1Q92837 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■■□ 3
FRAT1Q92837 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
FRAT1Q92837 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
FRAT1Q92837 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
FRAT1Q92837 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
FRAT1Q92837 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
FRAT1Q92837 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
FRAT1Q92837 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
FRAT1Q92837 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
FRAT1Q92837 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
FRAT1Q92837 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
FRAT1Q92837 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
FRAT1Q92837 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
FRAT1Q92837 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
FRAT1Q92837 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
FRAT1Q92837 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
FRAT1Q92837 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.7■■■□□ 2.99
FRAT1Q92837 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
FRAT1Q92837 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
FRAT1Q92837 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
FRAT1Q92837 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
FRAT1Q92837 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
FRAT1Q92837 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
FRAT1Q92837 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
FRAT1Q92837 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
FRAT1Q92837 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
FRAT1Q92837 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
FRAT1Q92837 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
FRAT1Q92837 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
FRAT1Q92837 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
FRAT1Q92837 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
FRAT1Q92837 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
FRAT1Q92837 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
FRAT1Q92837 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
FRAT1Q92837 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
FRAT1Q92837 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
FRAT1Q92837 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
FRAT1Q92837 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
FRAT1Q92837 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
FRAT1Q92837 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
FRAT1Q92837 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
FRAT1Q92837 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
FRAT1Q92837 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
FRAT1Q92837 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
FRAT1Q92837 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
FRAT1Q92837 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
FRAT1Q92837 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
FRAT1Q92837 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
FRAT1Q92837 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
FRAT1Q92837 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
FRAT1Q92837 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
FRAT1Q92837 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
FRAT1Q92837 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
FRAT1Q92837 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
FRAT1Q92837 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
FRAT1Q92837 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
FRAT1Q92837 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
FRAT1Q92837 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
FRAT1Q92837 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
FRAT1Q92837 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
FRAT1Q92837 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
FRAT1Q92837 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
FRAT1Q92837 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
FRAT1Q92837 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
FRAT1Q92837 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
FRAT1Q92837 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
FRAT1Q92837 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
FRAT1Q92837 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
FRAT1Q92837 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
FRAT1Q92837 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
FRAT1Q92837 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
FRAT1Q92837 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
FRAT1Q92837 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
FRAT1Q92837 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
FRAT1Q92837 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
FRAT1Q92837 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
FRAT1Q92837 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
FRAT1Q92837 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
FRAT1Q92837 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
FRAT1Q92837 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
FRAT1Q92837 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
FRAT1Q92837 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
FRAT1Q92837 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
FRAT1Q92837 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
FRAT1Q92837 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
FRAT1Q92837 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
FRAT1Q92837 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
FRAT1Q92837 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
FRAT1Q92837 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
FRAT1Q92837 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
FRAT1Q92837 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
FRAT1Q92837 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
FRAT1Q92837 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
FRAT1Q92837 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
FRAT1Q92837 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
FRAT1Q92837 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms