Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ04

LRTOMT, Transmembrane O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRTOMTQ8WZ04 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRTOMTQ8WZ04 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRTOMTQ8WZ04 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRTOMTQ8WZ04 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRTOMTQ8WZ04 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRTOMTQ8WZ04 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRTOMTQ8WZ04 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRTOMTQ8WZ04 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRTOMTQ8WZ04 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRTOMTQ8WZ04 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRTOMTQ8WZ04 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRTOMTQ8WZ04 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRTOMTQ8WZ04 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRTOMTQ8WZ04 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRTOMTQ8WZ04 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRTOMTQ8WZ04 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRTOMTQ8WZ04 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRTOMTQ8WZ04 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRTOMTQ8WZ04 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRTOMTQ8WZ04 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRTOMTQ8WZ04 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRTOMTQ8WZ04 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRTOMTQ8WZ04 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRTOMTQ8WZ04 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRTOMTQ8WZ04 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRTOMTQ8WZ04 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRTOMTQ8WZ04 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRTOMTQ8WZ04 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRTOMTQ8WZ04 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRTOMTQ8WZ04 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRTOMTQ8WZ04 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRTOMTQ8WZ04 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRTOMTQ8WZ04 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRTOMTQ8WZ04 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRTOMTQ8WZ04 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRTOMTQ8WZ04 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRTOMTQ8WZ04 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRTOMTQ8WZ04 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRTOMTQ8WZ04 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRTOMTQ8WZ04 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRTOMTQ8WZ04 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRTOMTQ8WZ04 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRTOMTQ8WZ04 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRTOMTQ8WZ04 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRTOMTQ8WZ04 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRTOMTQ8WZ04 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRTOMTQ8WZ04 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRTOMTQ8WZ04 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRTOMTQ8WZ04 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRTOMTQ8WZ04 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRTOMTQ8WZ04 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRTOMTQ8WZ04 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRTOMTQ8WZ04 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRTOMTQ8WZ04 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRTOMTQ8WZ04 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRTOMTQ8WZ04 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRTOMTQ8WZ04 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRTOMTQ8WZ04 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRTOMTQ8WZ04 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRTOMTQ8WZ04 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRTOMTQ8WZ04 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRTOMTQ8WZ04 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRTOMTQ8WZ04 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRTOMTQ8WZ04 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRTOMTQ8WZ04 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRTOMTQ8WZ04 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRTOMTQ8WZ04 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRTOMTQ8WZ04 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRTOMTQ8WZ04 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRTOMTQ8WZ04 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRTOMTQ8WZ04 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRTOMTQ8WZ04 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRTOMTQ8WZ04 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRTOMTQ8WZ04 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRTOMTQ8WZ04 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRTOMTQ8WZ04 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRTOMTQ8WZ04 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRTOMTQ8WZ04 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRTOMTQ8WZ04 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRTOMTQ8WZ04 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRTOMTQ8WZ04 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRTOMTQ8WZ04 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRTOMTQ8WZ04 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRTOMTQ8WZ04 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRTOMTQ8WZ04 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRTOMTQ8WZ04 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRTOMTQ8WZ04 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRTOMTQ8WZ04 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRTOMTQ8WZ04 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRTOMTQ8WZ04 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRTOMTQ8WZ04 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRTOMTQ8WZ04 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRTOMTQ8WZ04 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRTOMTQ8WZ04 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRTOMTQ8WZ04 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LRTOMTQ8WZ04 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRTOMTQ8WZ04 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRTOMTQ8WZ04 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRTOMTQ8WZ04 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRTOMTQ8WZ04 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms