Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCSAMQ8N6F7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCSAMQ8N6F7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCSAMQ8N6F7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCSAMQ8N6F7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCSAMQ8N6F7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCSAMQ8N6F7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCSAMQ8N6F7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCSAMQ8N6F7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCSAMQ8N6F7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCSAMQ8N6F7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCSAMQ8N6F7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GCSAMQ8N6F7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCSAMQ8N6F7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCSAMQ8N6F7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCSAMQ8N6F7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCSAMQ8N6F7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCSAMQ8N6F7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCSAMQ8N6F7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCSAMQ8N6F7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCSAMQ8N6F7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GCSAMQ8N6F7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCSAMQ8N6F7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCSAMQ8N6F7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCSAMQ8N6F7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCSAMQ8N6F7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCSAMQ8N6F7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCSAMQ8N6F7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCSAMQ8N6F7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCSAMQ8N6F7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCSAMQ8N6F7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GCSAMQ8N6F7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCSAMQ8N6F7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCSAMQ8N6F7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCSAMQ8N6F7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCSAMQ8N6F7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCSAMQ8N6F7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCSAMQ8N6F7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GCSAMQ8N6F7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCSAMQ8N6F7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCSAMQ8N6F7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCSAMQ8N6F7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCSAMQ8N6F7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCSAMQ8N6F7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCSAMQ8N6F7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GCSAMQ8N6F7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCSAMQ8N6F7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCSAMQ8N6F7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCSAMQ8N6F7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCSAMQ8N6F7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GCSAMQ8N6F7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCSAMQ8N6F7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCSAMQ8N6F7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCSAMQ8N6F7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCSAMQ8N6F7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GCSAMQ8N6F7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCSAMQ8N6F7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCSAMQ8N6F7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCSAMQ8N6F7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCSAMQ8N6F7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCSAMQ8N6F7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCSAMQ8N6F7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCSAMQ8N6F7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCSAMQ8N6F7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GCSAMQ8N6F7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCSAMQ8N6F7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCSAMQ8N6F7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCSAMQ8N6F7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCSAMQ8N6F7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCSAMQ8N6F7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCSAMQ8N6F7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCSAMQ8N6F7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCSAMQ8N6F7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCSAMQ8N6F7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCSAMQ8N6F7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCSAMQ8N6F7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCSAMQ8N6F7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCSAMQ8N6F7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCSAMQ8N6F7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCSAMQ8N6F7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCSAMQ8N6F7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCSAMQ8N6F7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCSAMQ8N6F7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCSAMQ8N6F7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCSAMQ8N6F7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCSAMQ8N6F7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCSAMQ8N6F7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCSAMQ8N6F7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCSAMQ8N6F7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCSAMQ8N6F7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCSAMQ8N6F7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCSAMQ8N6F7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCSAMQ8N6F7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCSAMQ8N6F7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCSAMQ8N6F7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCSAMQ8N6F7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GCSAMQ8N6F7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCSAMQ8N6F7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCSAMQ8N6F7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCSAMQ8N6F7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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