Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
XIRP1Q702N8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
XIRP1Q702N8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
XIRP1Q702N8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC37.79■■■■□ 3.64
XIRP1Q702N8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
XIRP1Q702N8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
XIRP1Q702N8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC37.77■■■■□ 3.64
XIRP1Q702N8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC37.76■■■■□ 3.64
XIRP1Q702N8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
XIRP1Q702N8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
XIRP1Q702N8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
XIRP1Q702N8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
XIRP1Q702N8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
XIRP1Q702N8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
XIRP1Q702N8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
XIRP1Q702N8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
XIRP1Q702N8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
XIRP1Q702N8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
XIRP1Q702N8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
XIRP1Q702N8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
XIRP1Q702N8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC37.69■■■■□ 3.62
XIRP1Q702N8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
XIRP1Q702N8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC37.66■■■■□ 3.62
XIRP1Q702N8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
XIRP1Q702N8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
XIRP1Q702N8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
XIRP1Q702N8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
XIRP1Q702N8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
XIRP1Q702N8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
XIRP1Q702N8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
XIRP1Q702N8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
XIRP1Q702N8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
XIRP1Q702N8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
XIRP1Q702N8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
XIRP1Q702N8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
XIRP1Q702N8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
XIRP1Q702N8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
XIRP1Q702N8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
XIRP1Q702N8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
XIRP1Q702N8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
XIRP1Q702N8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
XIRP1Q702N8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
XIRP1Q702N8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
XIRP1Q702N8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
XIRP1Q702N8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
XIRP1Q702N8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
XIRP1Q702N8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
XIRP1Q702N8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
XIRP1Q702N8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
XIRP1Q702N8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
XIRP1Q702N8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
XIRP1Q702N8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
XIRP1Q702N8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
XIRP1Q702N8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
XIRP1Q702N8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC37.45■■■■□ 3.59
XIRP1Q702N8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
XIRP1Q702N8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
XIRP1Q702N8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
XIRP1Q702N8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
XIRP1Q702N8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
XIRP1Q702N8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
XIRP1Q702N8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
XIRP1Q702N8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
XIRP1Q702N8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
XIRP1Q702N8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
XIRP1Q702N8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.58
XIRP1Q702N8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.58
XIRP1Q702N8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.38■■■■□ 3.57
XIRP1Q702N8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
XIRP1Q702N8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
XIRP1Q702N8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
XIRP1Q702N8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
XIRP1Q702N8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
XIRP1Q702N8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
XIRP1Q702N8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
XIRP1Q702N8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
XIRP1Q702N8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
XIRP1Q702N8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
XIRP1Q702N8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
XIRP1Q702N8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
XIRP1Q702N8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
XIRP1Q702N8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
XIRP1Q702N8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC37.25■■■■□ 3.55
XIRP1Q702N8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
XIRP1Q702N8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
XIRP1Q702N8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
XIRP1Q702N8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
XIRP1Q702N8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
XIRP1Q702N8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
XIRP1Q702N8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.54
XIRP1Q702N8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
XIRP1Q702N8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
XIRP1Q702N8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
XIRP1Q702N8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
XIRP1Q702N8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
XIRP1Q702N8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
XIRP1Q702N8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
XIRP1Q702N8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
XIRP1Q702N8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
XIRP1Q702N8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms