Protein–RNA interactions for Protein: Q6W349

LINC00575, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00575, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00575Q6W349 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00575Q6W349 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00575Q6W349 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00575Q6W349 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00575Q6W349 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00575Q6W349 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00575Q6W349 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00575Q6W349 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00575Q6W349 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00575Q6W349 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00575Q6W349 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00575Q6W349 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00575Q6W349 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00575Q6W349 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00575Q6W349 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00575Q6W349 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00575Q6W349 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00575Q6W349 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00575Q6W349 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00575Q6W349 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00575Q6W349 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00575Q6W349 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00575Q6W349 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00575Q6W349 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00575Q6W349 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00575Q6W349 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00575Q6W349 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00575Q6W349 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00575Q6W349 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00575Q6W349 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00575Q6W349 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00575Q6W349 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00575Q6W349 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00575Q6W349 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00575Q6W349 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00575Q6W349 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00575Q6W349 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00575Q6W349 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00575Q6W349 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00575Q6W349 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00575Q6W349 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00575Q6W349 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00575Q6W349 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00575Q6W349 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00575Q6W349 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00575Q6W349 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00575Q6W349 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00575Q6W349 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00575Q6W349 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00575Q6W349 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00575Q6W349 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00575Q6W349 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00575Q6W349 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00575Q6W349 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00575Q6W349 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00575Q6W349 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00575Q6W349 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00575Q6W349 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00575Q6W349 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00575Q6W349 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00575Q6W349 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00575Q6W349 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00575Q6W349 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00575Q6W349 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00575Q6W349 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00575Q6W349 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00575Q6W349 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00575Q6W349 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00575Q6W349 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00575Q6W349 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00575Q6W349 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00575Q6W349 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00575Q6W349 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00575Q6W349 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00575Q6W349 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00575Q6W349 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00575Q6W349 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00575Q6W349 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00575Q6W349 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00575Q6W349 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00575Q6W349 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00575Q6W349 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00575Q6W349 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00575Q6W349 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00575Q6W349 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00575Q6W349 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00575Q6W349 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00575Q6W349 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00575Q6W349 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00575Q6W349 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00575Q6W349 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00575Q6W349 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00575Q6W349 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00575Q6W349 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00575Q6W349 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00575Q6W349 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00575Q6W349 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00575Q6W349 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00575Q6W349 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00575Q6W349 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 315 ms