Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMBOX1Q6NT76 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HMBOX1Q6NT76 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMBOX1Q6NT76 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMBOX1Q6NT76 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMBOX1Q6NT76 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMBOX1Q6NT76 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMBOX1Q6NT76 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMBOX1Q6NT76 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMBOX1Q6NT76 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HMBOX1Q6NT76 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMBOX1Q6NT76 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMBOX1Q6NT76 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMBOX1Q6NT76 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMBOX1Q6NT76 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMBOX1Q6NT76 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMBOX1Q6NT76 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMBOX1Q6NT76 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMBOX1Q6NT76 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMBOX1Q6NT76 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMBOX1Q6NT76 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMBOX1Q6NT76 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMBOX1Q6NT76 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMBOX1Q6NT76 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMBOX1Q6NT76 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMBOX1Q6NT76 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMBOX1Q6NT76 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMBOX1Q6NT76 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMBOX1Q6NT76 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HMBOX1Q6NT76 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMBOX1Q6NT76 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMBOX1Q6NT76 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMBOX1Q6NT76 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMBOX1Q6NT76 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMBOX1Q6NT76 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMBOX1Q6NT76 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMBOX1Q6NT76 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMBOX1Q6NT76 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMBOX1Q6NT76 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMBOX1Q6NT76 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMBOX1Q6NT76 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMBOX1Q6NT76 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMBOX1Q6NT76 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMBOX1Q6NT76 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMBOX1Q6NT76 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMBOX1Q6NT76 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMBOX1Q6NT76 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMBOX1Q6NT76 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMBOX1Q6NT76 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMBOX1Q6NT76 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMBOX1Q6NT76 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMBOX1Q6NT76 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMBOX1Q6NT76 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMBOX1Q6NT76 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMBOX1Q6NT76 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMBOX1Q6NT76 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMBOX1Q6NT76 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMBOX1Q6NT76 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMBOX1Q6NT76 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMBOX1Q6NT76 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMBOX1Q6NT76 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMBOX1Q6NT76 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMBOX1Q6NT76 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMBOX1Q6NT76 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMBOX1Q6NT76 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMBOX1Q6NT76 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMBOX1Q6NT76 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMBOX1Q6NT76 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMBOX1Q6NT76 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMBOX1Q6NT76 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMBOX1Q6NT76 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMBOX1Q6NT76 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMBOX1Q6NT76 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMBOX1Q6NT76 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMBOX1Q6NT76 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMBOX1Q6NT76 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMBOX1Q6NT76 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMBOX1Q6NT76 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMBOX1Q6NT76 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMBOX1Q6NT76 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMBOX1Q6NT76 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMBOX1Q6NT76 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMBOX1Q6NT76 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMBOX1Q6NT76 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMBOX1Q6NT76 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMBOX1Q6NT76 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMBOX1Q6NT76 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMBOX1Q6NT76 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMBOX1Q6NT76 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMBOX1Q6NT76 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMBOX1Q6NT76 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMBOX1Q6NT76 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMBOX1Q6NT76 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMBOX1Q6NT76 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMBOX1Q6NT76 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMBOX1Q6NT76 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMBOX1Q6NT76 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMBOX1Q6NT76 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMBOX1Q6NT76 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMBOX1Q6NT76 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms