Protein–RNA interactions for Protein: Q5RL73

RBM48, RNA-binding protein 48, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM48Q5RL73 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM48Q5RL73 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM48Q5RL73 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM48Q5RL73 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM48Q5RL73 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM48Q5RL73 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM48Q5RL73 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM48Q5RL73 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM48Q5RL73 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RBM48Q5RL73 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM48Q5RL73 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM48Q5RL73 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM48Q5RL73 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM48Q5RL73 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM48Q5RL73 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM48Q5RL73 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM48Q5RL73 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM48Q5RL73 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM48Q5RL73 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM48Q5RL73 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM48Q5RL73 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBM48Q5RL73 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBM48Q5RL73 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBM48Q5RL73 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM48Q5RL73 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM48Q5RL73 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBM48Q5RL73 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RBM48Q5RL73 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBM48Q5RL73 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM48Q5RL73 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM48Q5RL73 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM48Q5RL73 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM48Q5RL73 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM48Q5RL73 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBM48Q5RL73 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBM48Q5RL73 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBM48Q5RL73 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBM48Q5RL73 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBM48Q5RL73 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBM48Q5RL73 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBM48Q5RL73 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBM48Q5RL73 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBM48Q5RL73 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBM48Q5RL73 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBM48Q5RL73 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBM48Q5RL73 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBM48Q5RL73 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBM48Q5RL73 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBM48Q5RL73 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBM48Q5RL73 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RBM48Q5RL73 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RBM48Q5RL73 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBM48Q5RL73 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBM48Q5RL73 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBM48Q5RL73 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBM48Q5RL73 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBM48Q5RL73 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBM48Q5RL73 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBM48Q5RL73 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBM48Q5RL73 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBM48Q5RL73 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBM48Q5RL73 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBM48Q5RL73 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBM48Q5RL73 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBM48Q5RL73 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBM48Q5RL73 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBM48Q5RL73 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBM48Q5RL73 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBM48Q5RL73 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBM48Q5RL73 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBM48Q5RL73 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RBM48Q5RL73 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBM48Q5RL73 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBM48Q5RL73 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBM48Q5RL73 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBM48Q5RL73 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBM48Q5RL73 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBM48Q5RL73 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBM48Q5RL73 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBM48Q5RL73 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBM48Q5RL73 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBM48Q5RL73 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBM48Q5RL73 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBM48Q5RL73 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBM48Q5RL73 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBM48Q5RL73 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBM48Q5RL73 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBM48Q5RL73 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBM48Q5RL73 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBM48Q5RL73 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBM48Q5RL73 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBM48Q5RL73 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBM48Q5RL73 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBM48Q5RL73 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBM48Q5RL73 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBM48Q5RL73 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBM48Q5RL73 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBM48Q5RL73 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBM48Q5RL73 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBM48Q5RL73 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms