Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKDCCQ504Y2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PKDCCQ504Y2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PKDCCQ504Y2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PKDCCQ504Y2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PKDCCQ504Y2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PKDCCQ504Y2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKDCCQ504Y2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKDCCQ504Y2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKDCCQ504Y2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKDCCQ504Y2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PKDCCQ504Y2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PKDCCQ504Y2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PKDCCQ504Y2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PKDCCQ504Y2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PKDCCQ504Y2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PKDCCQ504Y2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PKDCCQ504Y2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PKDCCQ504Y2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKDCCQ504Y2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKDCCQ504Y2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PKDCCQ504Y2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKDCCQ504Y2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKDCCQ504Y2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKDCCQ504Y2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKDCCQ504Y2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PKDCCQ504Y2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PKDCCQ504Y2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PKDCCQ504Y2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PKDCCQ504Y2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PKDCCQ504Y2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PKDCCQ504Y2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PKDCCQ504Y2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PKDCCQ504Y2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PKDCCQ504Y2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PKDCCQ504Y2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PKDCCQ504Y2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PKDCCQ504Y2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PKDCCQ504Y2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PKDCCQ504Y2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PKDCCQ504Y2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PKDCCQ504Y2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PKDCCQ504Y2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PKDCCQ504Y2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PKDCCQ504Y2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PKDCCQ504Y2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PKDCCQ504Y2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PKDCCQ504Y2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PKDCCQ504Y2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PKDCCQ504Y2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKDCCQ504Y2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKDCCQ504Y2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKDCCQ504Y2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PKDCCQ504Y2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PKDCCQ504Y2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PKDCCQ504Y2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PKDCCQ504Y2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PKDCCQ504Y2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PKDCCQ504Y2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PKDCCQ504Y2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PKDCCQ504Y2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PKDCCQ504Y2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PKDCCQ504Y2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PKDCCQ504Y2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKDCCQ504Y2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKDCCQ504Y2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKDCCQ504Y2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKDCCQ504Y2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKDCCQ504Y2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKDCCQ504Y2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKDCCQ504Y2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKDCCQ504Y2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKDCCQ504Y2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKDCCQ504Y2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKDCCQ504Y2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKDCCQ504Y2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKDCCQ504Y2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKDCCQ504Y2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKDCCQ504Y2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKDCCQ504Y2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKDCCQ504Y2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PKDCCQ504Y2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PKDCCQ504Y2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PKDCCQ504Y2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PKDCCQ504Y2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PKDCCQ504Y2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PKDCCQ504Y2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
PKDCCQ504Y2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PKDCCQ504Y2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PKDCCQ504Y2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PKDCCQ504Y2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PKDCCQ504Y2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PKDCCQ504Y2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PKDCCQ504Y2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PKDCCQ504Y2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PKDCCQ504Y2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PKDCCQ504Y2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PKDCCQ504Y2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PKDCCQ504Y2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PKDCCQ504Y2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms