Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ALCAMQ13740 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ALCAMQ13740 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ALCAMQ13740 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ALCAMQ13740 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ALCAMQ13740 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ALCAMQ13740 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ALCAMQ13740 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ALCAMQ13740 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ALCAMQ13740 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ALCAMQ13740 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ALCAMQ13740 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALCAMQ13740 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALCAMQ13740 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALCAMQ13740 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALCAMQ13740 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ALCAMQ13740 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ALCAMQ13740 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALCAMQ13740 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ALCAMQ13740 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ALCAMQ13740 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ALCAMQ13740 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ALCAMQ13740 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ALCAMQ13740 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ALCAMQ13740 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ALCAMQ13740 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ALCAMQ13740 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALCAMQ13740 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALCAMQ13740 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALCAMQ13740 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALCAMQ13740 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ALCAMQ13740 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ALCAMQ13740 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ALCAMQ13740 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ALCAMQ13740 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ALCAMQ13740 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ALCAMQ13740 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ALCAMQ13740 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ALCAMQ13740 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ALCAMQ13740 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ALCAMQ13740 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ALCAMQ13740 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ALCAMQ13740 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ALCAMQ13740 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ALCAMQ13740 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ALCAMQ13740 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ALCAMQ13740 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ALCAMQ13740 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ALCAMQ13740 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ALCAMQ13740 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ALCAMQ13740 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ALCAMQ13740 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ALCAMQ13740 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ALCAMQ13740 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ALCAMQ13740 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ALCAMQ13740 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALCAMQ13740 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALCAMQ13740 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALCAMQ13740 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALCAMQ13740 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ALCAMQ13740 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ALCAMQ13740 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ALCAMQ13740 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ALCAMQ13740 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ALCAMQ13740 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ALCAMQ13740 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ALCAMQ13740 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ALCAMQ13740 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ALCAMQ13740 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ALCAMQ13740 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ALCAMQ13740 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ALCAMQ13740 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ALCAMQ13740 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ALCAMQ13740 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ALCAMQ13740 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ALCAMQ13740 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ALCAMQ13740 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ALCAMQ13740 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ALCAMQ13740 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ALCAMQ13740 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ALCAMQ13740 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ALCAMQ13740 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ALCAMQ13740 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ALCAMQ13740 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ALCAMQ13740 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ALCAMQ13740 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ALCAMQ13740 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ALCAMQ13740 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ALCAMQ13740 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ALCAMQ13740 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ALCAMQ13740 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ALCAMQ13740 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ALCAMQ13740 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ALCAMQ13740 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ALCAMQ13740 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ALCAMQ13740 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ALCAMQ13740 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ALCAMQ13740 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ALCAMQ13740 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ALCAMQ13740 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
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