Protein–RNA interactions for Protein: Q13507

TRPC3, Short transient receptor potential channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC3Q13507 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRPC3Q13507 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRPC3Q13507 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRPC3Q13507 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRPC3Q13507 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TRPC3Q13507 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRPC3Q13507 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRPC3Q13507 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRPC3Q13507 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRPC3Q13507 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TRPC3Q13507 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRPC3Q13507 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRPC3Q13507 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TRPC3Q13507 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRPC3Q13507 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRPC3Q13507 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRPC3Q13507 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRPC3Q13507 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRPC3Q13507 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRPC3Q13507 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRPC3Q13507 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRPC3Q13507 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRPC3Q13507 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRPC3Q13507 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRPC3Q13507 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRPC3Q13507 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRPC3Q13507 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TRPC3Q13507 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRPC3Q13507 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRPC3Q13507 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRPC3Q13507 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRPC3Q13507 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRPC3Q13507 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRPC3Q13507 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRPC3Q13507 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRPC3Q13507 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TRPC3Q13507 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRPC3Q13507 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRPC3Q13507 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRPC3Q13507 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRPC3Q13507 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRPC3Q13507 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRPC3Q13507 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRPC3Q13507 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRPC3Q13507 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRPC3Q13507 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRPC3Q13507 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRPC3Q13507 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRPC3Q13507 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRPC3Q13507 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRPC3Q13507 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRPC3Q13507 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRPC3Q13507 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRPC3Q13507 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRPC3Q13507 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRPC3Q13507 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRPC3Q13507 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRPC3Q13507 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRPC3Q13507 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRPC3Q13507 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRPC3Q13507 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRPC3Q13507 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRPC3Q13507 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRPC3Q13507 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRPC3Q13507 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRPC3Q13507 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRPC3Q13507 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRPC3Q13507 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRPC3Q13507 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRPC3Q13507 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRPC3Q13507 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRPC3Q13507 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRPC3Q13507 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRPC3Q13507 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRPC3Q13507 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRPC3Q13507 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRPC3Q13507 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRPC3Q13507 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRPC3Q13507 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPC3Q13507 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPC3Q13507 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPC3Q13507 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPC3Q13507 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPC3Q13507 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPC3Q13507 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPC3Q13507 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPC3Q13507 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPC3Q13507 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPC3Q13507 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPC3Q13507 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPC3Q13507 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPC3Q13507 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPC3Q13507 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPC3Q13507 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPC3Q13507 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRPC3Q13507 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRPC3Q13507 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRPC3Q13507 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPC3Q13507 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPC3Q13507 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms