Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IFT88Q13099 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IFT88Q13099 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IFT88Q13099 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IFT88Q13099 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IFT88Q13099 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IFT88Q13099 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IFT88Q13099 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IFT88Q13099 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IFT88Q13099 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFT88Q13099 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFT88Q13099 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IFT88Q13099 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFT88Q13099 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IFT88Q13099 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IFT88Q13099 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IFT88Q13099 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFT88Q13099 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFT88Q13099 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IFT88Q13099 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IFT88Q13099 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT88Q13099 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT88Q13099 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFT88Q13099 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFT88Q13099 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFT88Q13099 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFT88Q13099 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFT88Q13099 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFT88Q13099 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFT88Q13099 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFT88Q13099 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFT88Q13099 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFT88Q13099 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFT88Q13099 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFT88Q13099 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFT88Q13099 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFT88Q13099 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFT88Q13099 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFT88Q13099 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFT88Q13099 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFT88Q13099 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFT88Q13099 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFT88Q13099 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFT88Q13099 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFT88Q13099 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFT88Q13099 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFT88Q13099 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFT88Q13099 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFT88Q13099 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFT88Q13099 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFT88Q13099 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFT88Q13099 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFT88Q13099 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFT88Q13099 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFT88Q13099 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFT88Q13099 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFT88Q13099 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFT88Q13099 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFT88Q13099 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFT88Q13099 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFT88Q13099 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFT88Q13099 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IFT88Q13099 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IFT88Q13099 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IFT88Q13099 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IFT88Q13099 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IFT88Q13099 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IFT88Q13099 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IFT88Q13099 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IFT88Q13099 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IFT88Q13099 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IFT88Q13099 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IFT88Q13099 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IFT88Q13099 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IFT88Q13099 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
IFT88Q13099 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IFT88Q13099 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
IFT88Q13099 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IFT88Q13099 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFT88Q13099 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFT88Q13099 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFT88Q13099 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IFT88Q13099 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IFT88Q13099 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFT88Q13099 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFT88Q13099 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IFT88Q13099 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IFT88Q13099 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IFT88Q13099 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IFT88Q13099 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFT88Q13099 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
IFT88Q13099 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
IFT88Q13099 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFT88Q13099 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFT88Q13099 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFT88Q13099 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFT88Q13099 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFT88Q13099 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFT88Q13099 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
IFT88Q13099 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
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