Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANK3Q12955 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANK3Q12955 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANK3Q12955 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANK3Q12955 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANK3Q12955 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANK3Q12955 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANK3Q12955 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ANK3Q12955 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANK3Q12955 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANK3Q12955 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANK3Q12955 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANK3Q12955 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANK3Q12955 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANK3Q12955 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANK3Q12955 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANK3Q12955 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANK3Q12955 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANK3Q12955 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANK3Q12955 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANK3Q12955 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANK3Q12955 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANK3Q12955 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANK3Q12955 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANK3Q12955 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANK3Q12955 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANK3Q12955 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANK3Q12955 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANK3Q12955 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANK3Q12955 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANK3Q12955 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANK3Q12955 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
ANK3Q12955 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ANK3Q12955 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANK3Q12955 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANK3Q12955 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANK3Q12955 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANK3Q12955 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANK3Q12955 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANK3Q12955 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANK3Q12955 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANK3Q12955 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANK3Q12955 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANK3Q12955 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANK3Q12955 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANK3Q12955 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANK3Q12955 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANK3Q12955 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANK3Q12955 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANK3Q12955 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANK3Q12955 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANK3Q12955 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANK3Q12955 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANK3Q12955 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANK3Q12955 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANK3Q12955 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANK3Q12955 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANK3Q12955 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANK3Q12955 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANK3Q12955 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANK3Q12955 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANK3Q12955 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANK3Q12955 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANK3Q12955 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANK3Q12955 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANK3Q12955 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANK3Q12955 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANK3Q12955 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANK3Q12955 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANK3Q12955 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANK3Q12955 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANK3Q12955 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANK3Q12955 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ANK3Q12955 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANK3Q12955 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ANK3Q12955 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANK3Q12955 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANK3Q12955 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANK3Q12955 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANK3Q12955 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANK3Q12955 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANK3Q12955 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANK3Q12955 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANK3Q12955 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANK3Q12955 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANK3Q12955 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANK3Q12955 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANK3Q12955 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANK3Q12955 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANK3Q12955 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANK3Q12955 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANK3Q12955 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANK3Q12955 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANK3Q12955 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ANK3Q12955 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANK3Q12955 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANK3Q12955 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANK3Q12955 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANK3Q12955 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANK3Q12955 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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