Protein–RNA interactions for Protein: Q06787

FMR1, Synaptic functional regulator FMR1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1Q06787 NFIA-212ENST00000485903 1674 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.711e-14■■■■■ 51.5
FMR1Q06787 NFIA-206ENST00000371191 1916 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.731e-14■■■■■ 51.5
FMR1Q06787 NFIA-208ENST00000407417 2123 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.851e-14■■■■■ 51.5
FMR1Q06787 LINC00923-203ENST00000558179 359 ntTSL 39.25□□□□□ -0.931e-14■■■■■ 51.5
FMR1Q06787 RBM6-207ENST00000434592 2342 ntTSL 27.98□□□□□ -1.131e-14■■■■■ 51.5
FMR1Q06787 NFIA-214ENST00000496712 603 ntTSL 37.92□□□□□ -1.141e-14■■■■■ 51.5
FMR1Q06787 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.271e-14■■■■■ 51.5
FMR1Q06787 EDEM3-203ENST00000439962 2872 ntTSL 1 (best)5.85□□□□□ -1.471e-14■■■■■ 51.5
FMR1Q06787 NFIA-209ENST00000476646 730 ntTSL 35.21□□□□□ -1.581e-14■■■■■ 51.5
FMR1Q06787 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.221e-8■■■■■ 51.5
FMR1Q06787 USP6NL-202ENST00000379237 4546 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.461e-8■■■■■ 51.5
FMR1Q06787 ALOX12-AS1-205ENST00000572385 576 ntTSL 416.46■□□□□ 0.237e-14■■■■■ 51.3
FMR1Q06787 ALOX12-AS1-209ENST00000575889 439 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.067e-14■■■■■ 51.3
FMR1Q06787 ALOX12-AS1-203ENST00000570562 567 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.097e-14■■■■■ 51.3
FMR1Q06787 PAK4-204ENST00000593480 714 ntTSL 325.19■■□□□ 1.621e-8■■■■■ 51.2
FMR1Q06787 PAK4-212ENST00000602004 564 ntTSL 424.06■■□□□ 1.441e-8■■■■■ 51.2
FMR1Q06787 PAK4-207ENST00000597766 380 ntTSL 323.15■■□□□ 1.31e-8■■■■■ 51.2
FMR1Q06787 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.91e-8■■■■■ 51.2
FMR1Q06787 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.841e-8■■■■■ 51.2
FMR1Q06787 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.761e-8■■■■■ 51.2
FMR1Q06787 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.411e-8■■■■■ 51.2
FMR1Q06787 TRAPPC12-209ENST00000441099 698 ntTSL 319.8■□□□□ 0.761e-13■■■■■ 51
FMR1Q06787 TRAPPC12-210ENST00000441983 683 ntTSL 318.06■□□□□ 0.481e-13■■■■■ 51
FMR1Q06787 TRAPPC12-215ENST00000469147 1002 ntTSL 312□□□□□ -0.491e-13■■■■■ 51
FMR1Q06787 KIF13A-213ENST00000636847 5538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.736e-8■■■■■ 50.8
FMR1Q06787 KIF13A-203ENST00000378814 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.826e-8■■■■■ 50.8
FMR1Q06787 KIF13A-204ENST00000378826 5747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.836e-8■■■■■ 50.8
FMR1Q06787 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.226e-8■■■■■ 50.8
FMR1Q06787 IWS1-212ENST00000637187 1021 ntTSL 57.58□□□□□ -1.21e-7■■■■■ 50.7
FMR1Q06787 MARCH3-202ENST00000502289 764 ntTSL 424.34■■□□□ 1.492e-14■■■■■ 50.5
FMR1Q06787 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.032e-14■■■■■ 50.5
FMR1Q06787 KIAA0355-204ENST00000588470 632 ntTSL 521.17■□□□□ 0.982e-14■■■■■ 50.5
FMR1Q06787 KIAA0355-206ENST00000589583 582 ntTSL 320.98■□□□□ 0.952e-14■■■■■ 50.5
FMR1Q06787 DANCR-202ENST00000425653 823 ntTSL 1 (best)20.23■□□□□ 0.832e-14■■■■■ 50.5
FMR1Q06787 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.832e-14■■■■■ 50.5
FMR1Q06787 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.452e-14■■■■■ 50.5
FMR1Q06787 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.392e-14■■■■■ 50.5
FMR1Q06787 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.052e-14■■■■■ 50.5
FMR1Q06787 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.12e-14■■■■■ 50.5
FMR1Q06787 DANCR-205ENST00000623036 748 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.162e-14■■■■■ 50.5
FMR1Q06787 KIAA0355-203ENST00000588338 561 ntTSL 511.95□□□□□ -0.52e-14■■■■■ 50.5
FMR1Q06787 KIAA0355-201ENST00000299505 6717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.712e-14■■■■■ 50.5
FMR1Q06787 CDC42-201ENST00000315554 1452 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.872e-14■■■■■ 50.5
FMR1Q06787 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.042e-14■■■■■ 50.5
FMR1Q06787 SUPT3H-205ENST00000475057 1377 ntTSL 28.34□□□□□ -1.072e-14■■■■■ 50.5
FMR1Q06787 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.182e-14■■■■■ 50.5
FMR1Q06787 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.422e-14■■■■■ 50.5
FMR1Q06787 FLNA-214ENST00000474072 430 ntTSL 221.05■□□□□ 0.961e-19■■■■■ 50.2
FMR1Q06787 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.643e-7■■■■■ 50.2
FMR1Q06787 AC022167.2-201ENST00000565934 2288 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.322e-13■■■■■ 50
FMR1Q06787 TFDP1-203ENST00000453989 792 ntTSL 329.93■■■□□ 2.384e-6■■■■■ 49.6
FMR1Q06787 TFDP1-202ENST00000408980 866 ntTSL 529.77■■■□□ 2.364e-6■■■■■ 49.6
FMR1Q06787 TFDP1-208ENST00000544902 1571 ntTSL 227.15■■□□□ 1.944e-6■■■■■ 49.6
FMR1Q06787 TFDP1-206ENST00000475254 804 ntTSL 323.42■■□□□ 1.344e-6■■■■■ 49.6
FMR1Q06787 TFDP1-205ENST00000465174 955 ntTSL 317.55■□□□□ 0.44e-6■■■■■ 49.6
FMR1Q06787 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.264e-6■■■■■ 49.6
FMR1Q06787 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.674e-8■■■■■ 49.5
FMR1Q06787 PICALM-210ENST00000528411 586 ntTSL 518.76■□□□□ 0.594e-8■■■■■ 49.5
FMR1Q06787 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.514e-8■■■■■ 49.5
FMR1Q06787 PICALM-217ENST00000531930 703 ntTSL 59.77□□□□□ -0.854e-8■■■■■ 49.5
FMR1Q06787 PICALM-203ENST00000525162 548 ntTSL 49.5□□□□□ -0.894e-8■■■■■ 49.5
FMR1Q06787 PICALM-208ENST00000528256 563 ntTSL 49.04□□□□□ -0.964e-8■■■■■ 49.5
FMR1Q06787 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.484e-8■■■■■ 49.5
FMR1Q06787 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.295e-14■■■■■ 49.4
FMR1Q06787 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.665e-14■■■■■ 49.4
FMR1Q06787 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.615e-14■■■■■ 49.4
FMR1Q06787 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.385e-14■■■■■ 49.4
FMR1Q06787 RNASET2-204ENST00000421787 1924 ntTSL 223.45■■□□□ 1.345e-14■■■■■ 49.4
FMR1Q06787 RNASET2-207ENST00000478180 963 ntTSL 523.24■■□□□ 1.315e-14■■■■■ 49.4
FMR1Q06787 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.175e-14■■■■■ 49.4
FMR1Q06787 RNASET2-201ENST00000028008 1220 ntTSL 522.32■■□□□ 1.165e-14■■■■■ 49.4
FMR1Q06787 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.885e-14■■■■■ 49.4
FMR1Q06787 RNASET2-202ENST00000358165 2445 ntTSL 218.81■□□□□ 0.65e-14■■■■■ 49.4
FMR1Q06787 RNASET2-209ENST00000499370 2164 ntTSL 212.57□□□□□ -0.45e-14■■■■■ 49.4
FMR1Q06787 RNASET2-208ENST00000496851 881 ntTSL 511.16□□□□□ -0.625e-14■■■■■ 49.4
FMR1Q06787 DNAJC8-206ENST00000603289 483 ntTSL 510.38□□□□□ -0.755e-14■■■■■ 49.4
FMR1Q06787 LINC00641-201ENST00000555379 5425 nt8.57□□□□□ -1.045e-14■■■■■ 49.4
FMR1Q06787 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.285e-14■■■■■ 49.4
FMR1Q06787 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.851e-12■■■■■ 49.3
FMR1Q06787 FAM238C-202ENST00000639963 1787 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.111e-12■■■■■ 49.3
FMR1Q06787 FAM238C-201ENST00000638416 868 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.081e-12■■■■■ 49.3
FMR1Q06787 FAM238C-203ENST00000640121 3620 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.481e-12■■■■■ 49.3
FMR1Q06787 FAM238C-205ENST00000640641 391 ntBASIC11.1□□□□□ -0.631e-12■■■■■ 49.3
FMR1Q06787 PYGO2-203ENST00000483463 594 ntTSL 26.56□□□□□ -1.361e-13■■■■■ 48.4
FMR1Q06787 PSMG4-210ENST00000509933 2241 ntTSL 216.52■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 47.9
FMR1Q06787 SUPT16H-204ENST00000555943 915 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.956e-13■■■■■ 47.6
FMR1Q06787 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.847e-11■■■■■ 47.5
FMR1Q06787 SREK1-212ENST00000522912 2047 ntTSL 1 (best)19.05■□□□□ 0.647e-11■■■■■ 47.5
FMR1Q06787 SREK1-209ENST00000520953 2172 ntTSL 517.58■□□□□ 0.47e-11■■■■■ 47.5
FMR1Q06787 SREK1-202ENST00000334121 6781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.557e-11■■■■■ 47.5
FMR1Q06787 SREK1-215ENST00000524111 4074 ntTSL 59.86□□□□□ -0.837e-11■■■■■ 47.5
FMR1Q06787 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.187e-11■■■■■ 47.5
FMR1Q06787 SREK1-210ENST00000521691 580 ntTSL 35.48□□□□□ -1.537e-11■■■■■ 47.5
FMR1Q06787 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.772e-13■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.62e-13■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 LINC00969-244ENST00000602127 749 ntTSL 518.68■□□□□ 0.582e-17■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.582e-17■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 LINC00969-313ENST00000628917 490 ntTSL 518.68■□□□□ 0.582e-17■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 LINC00969-217ENST00000451982 1161 ntTSL 517.35■□□□□ 0.372e-17■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.352e-13■■■■■ 47.4
Retrieved 100 of 13,491 protein–RNA pairs in 196.5 ms