Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DEUP1Q05D60 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DEUP1Q05D60 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DEUP1Q05D60 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DEUP1Q05D60 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DEUP1Q05D60 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DEUP1Q05D60 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DEUP1Q05D60 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DEUP1Q05D60 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DEUP1Q05D60 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DEUP1Q05D60 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DEUP1Q05D60 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DEUP1Q05D60 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DEUP1Q05D60 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DEUP1Q05D60 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DEUP1Q05D60 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
DEUP1Q05D60 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DEUP1Q05D60 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DEUP1Q05D60 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DEUP1Q05D60 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DEUP1Q05D60 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DEUP1Q05D60 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DEUP1Q05D60 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
DEUP1Q05D60 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DEUP1Q05D60 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DEUP1Q05D60 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DEUP1Q05D60 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DEUP1Q05D60 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DEUP1Q05D60 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DEUP1Q05D60 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DEUP1Q05D60 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DEUP1Q05D60 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DEUP1Q05D60 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DEUP1Q05D60 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DEUP1Q05D60 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DEUP1Q05D60 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DEUP1Q05D60 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DEUP1Q05D60 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DEUP1Q05D60 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DEUP1Q05D60 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DEUP1Q05D60 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DEUP1Q05D60 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DEUP1Q05D60 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DEUP1Q05D60 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DEUP1Q05D60 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DEUP1Q05D60 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DEUP1Q05D60 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DEUP1Q05D60 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DEUP1Q05D60 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DEUP1Q05D60 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DEUP1Q05D60 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DEUP1Q05D60 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DEUP1Q05D60 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DEUP1Q05D60 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
DEUP1Q05D60 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DEUP1Q05D60 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DEUP1Q05D60 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DEUP1Q05D60 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DEUP1Q05D60 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DEUP1Q05D60 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DEUP1Q05D60 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DEUP1Q05D60 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DEUP1Q05D60 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DEUP1Q05D60 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DEUP1Q05D60 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DEUP1Q05D60 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DEUP1Q05D60 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DEUP1Q05D60 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DEUP1Q05D60 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DEUP1Q05D60 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DEUP1Q05D60 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
DEUP1Q05D60 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DEUP1Q05D60 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DEUP1Q05D60 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DEUP1Q05D60 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DEUP1Q05D60 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DEUP1Q05D60 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DEUP1Q05D60 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DEUP1Q05D60 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DEUP1Q05D60 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DEUP1Q05D60 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DEUP1Q05D60 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DEUP1Q05D60 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DEUP1Q05D60 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DEUP1Q05D60 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DEUP1Q05D60 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DEUP1Q05D60 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DEUP1Q05D60 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DEUP1Q05D60 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DEUP1Q05D60 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DEUP1Q05D60 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DEUP1Q05D60 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DEUP1Q05D60 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DEUP1Q05D60 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DEUP1Q05D60 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DEUP1Q05D60 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
DEUP1Q05D60 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DEUP1Q05D60 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DEUP1Q05D60 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DEUP1Q05D60 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms