Protein–RNA interactions for Protein: Q03403

TFF2, Trefoil factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF2Q03403 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TFF2Q03403 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TFF2Q03403 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TFF2Q03403 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TFF2Q03403 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TFF2Q03403 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TFF2Q03403 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TFF2Q03403 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TFF2Q03403 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TFF2Q03403 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TFF2Q03403 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TFF2Q03403 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TFF2Q03403 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TFF2Q03403 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TFF2Q03403 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TFF2Q03403 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TFF2Q03403 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TFF2Q03403 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TFF2Q03403 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TFF2Q03403 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TFF2Q03403 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TFF2Q03403 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TFF2Q03403 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TFF2Q03403 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TFF2Q03403 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TFF2Q03403 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TFF2Q03403 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TFF2Q03403 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TFF2Q03403 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TFF2Q03403 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TFF2Q03403 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TFF2Q03403 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TFF2Q03403 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TFF2Q03403 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TFF2Q03403 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TFF2Q03403 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TFF2Q03403 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TFF2Q03403 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TFF2Q03403 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TFF2Q03403 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TFF2Q03403 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TFF2Q03403 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TFF2Q03403 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TFF2Q03403 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TFF2Q03403 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TFF2Q03403 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TFF2Q03403 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TFF2Q03403 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TFF2Q03403 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TFF2Q03403 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TFF2Q03403 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TFF2Q03403 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TFF2Q03403 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TFF2Q03403 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TFF2Q03403 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TFF2Q03403 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TFF2Q03403 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TFF2Q03403 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TFF2Q03403 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TFF2Q03403 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TFF2Q03403 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TFF2Q03403 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TFF2Q03403 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TFF2Q03403 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TFF2Q03403 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TFF2Q03403 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TFF2Q03403 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TFF2Q03403 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TFF2Q03403 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TFF2Q03403 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TFF2Q03403 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TFF2Q03403 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TFF2Q03403 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TFF2Q03403 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TFF2Q03403 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TFF2Q03403 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TFF2Q03403 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TFF2Q03403 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TFF2Q03403 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TFF2Q03403 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TFF2Q03403 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TFF2Q03403 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TFF2Q03403 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TFF2Q03403 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TFF2Q03403 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TFF2Q03403 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TFF2Q03403 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TFF2Q03403 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TFF2Q03403 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TFF2Q03403 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TFF2Q03403 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TFF2Q03403 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TFF2Q03403 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TFF2Q03403 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TFF2Q03403 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TFF2Q03403 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TFF2Q03403 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TFF2Q03403 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TFF2Q03403 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TFF2Q03403 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms