Protein–RNA interactions for Protein: P78368

CSNK1G2, Casein kinase I isoform gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2P78368 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSNK1G2P78368 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSNK1G2P78368 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSNK1G2P78368 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSNK1G2P78368 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSNK1G2P78368 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSNK1G2P78368 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSNK1G2P78368 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSNK1G2P78368 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSNK1G2P78368 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSNK1G2P78368 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSNK1G2P78368 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CSNK1G2P78368 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSNK1G2P78368 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSNK1G2P78368 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSNK1G2P78368 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSNK1G2P78368 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSNK1G2P78368 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CSNK1G2P78368 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSNK1G2P78368 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSNK1G2P78368 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSNK1G2P78368 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSNK1G2P78368 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSNK1G2P78368 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSNK1G2P78368 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSNK1G2P78368 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSNK1G2P78368 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSNK1G2P78368 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSNK1G2P78368 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSNK1G2P78368 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSNK1G2P78368 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSNK1G2P78368 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSNK1G2P78368 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSNK1G2P78368 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSNK1G2P78368 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSNK1G2P78368 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSNK1G2P78368 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSNK1G2P78368 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSNK1G2P78368 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSNK1G2P78368 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CSNK1G2P78368 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CSNK1G2P78368 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSNK1G2P78368 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSNK1G2P78368 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CSNK1G2P78368 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSNK1G2P78368 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSNK1G2P78368 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSNK1G2P78368 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSNK1G2P78368 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSNK1G2P78368 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSNK1G2P78368 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSNK1G2P78368 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSNK1G2P78368 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSNK1G2P78368 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSNK1G2P78368 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSNK1G2P78368 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSNK1G2P78368 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSNK1G2P78368 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSNK1G2P78368 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSNK1G2P78368 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSNK1G2P78368 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSNK1G2P78368 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSNK1G2P78368 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSNK1G2P78368 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSNK1G2P78368 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSNK1G2P78368 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSNK1G2P78368 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSNK1G2P78368 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSNK1G2P78368 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSNK1G2P78368 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSNK1G2P78368 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSNK1G2P78368 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSNK1G2P78368 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSNK1G2P78368 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSNK1G2P78368 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSNK1G2P78368 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSNK1G2P78368 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSNK1G2P78368 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSNK1G2P78368 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSNK1G2P78368 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSNK1G2P78368 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSNK1G2P78368 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSNK1G2P78368 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSNK1G2P78368 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSNK1G2P78368 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CSNK1G2P78368 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSNK1G2P78368 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSNK1G2P78368 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSNK1G2P78368 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSNK1G2P78368 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSNK1G2P78368 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CSNK1G2P78368 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CSNK1G2P78368 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CSNK1G2P78368 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CSNK1G2P78368 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSNK1G2P78368 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSNK1G2P78368 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSNK1G2P78368 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSNK1G2P78368 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSNK1G2P78368 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms