Protein–RNA interactions for Protein: P62899

RPL31, 60S ribosomal protein L31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL31P62899 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL31P62899 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL31P62899 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL31P62899 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL31P62899 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL31P62899 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL31P62899 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL31P62899 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL31P62899 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL31P62899 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL31P62899 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL31P62899 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL31P62899 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL31P62899 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL31P62899 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL31P62899 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL31P62899 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL31P62899 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL31P62899 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL31P62899 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL31P62899 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL31P62899 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL31P62899 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL31P62899 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL31P62899 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL31P62899 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL31P62899 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL31P62899 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL31P62899 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL31P62899 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL31P62899 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL31P62899 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL31P62899 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL31P62899 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL31P62899 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL31P62899 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL31P62899 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL31P62899 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL31P62899 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL31P62899 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL31P62899 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL31P62899 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL31P62899 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL31P62899 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RPL31P62899 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL31P62899 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL31P62899 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL31P62899 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL31P62899 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL31P62899 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL31P62899 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL31P62899 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL31P62899 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL31P62899 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL31P62899 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL31P62899 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL31P62899 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL31P62899 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL31P62899 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL31P62899 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL31P62899 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL31P62899 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL31P62899 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL31P62899 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL31P62899 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL31P62899 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL31P62899 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL31P62899 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL31P62899 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL31P62899 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL31P62899 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL31P62899 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL31P62899 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL31P62899 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL31P62899 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL31P62899 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL31P62899 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL31P62899 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL31P62899 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL31P62899 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL31P62899 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL31P62899 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL31P62899 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL31P62899 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL31P62899 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL31P62899 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL31P62899 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL31P62899 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL31P62899 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL31P62899 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL31P62899 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL31P62899 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL31P62899 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL31P62899 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL31P62899 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPL31P62899 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPL31P62899 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL31P62899 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL31P62899 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL31P62899 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms