Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SLC4A3P48751 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SLC4A3P48751 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SLC4A3P48751 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
SLC4A3P48751 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SLC4A3P48751 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SLC4A3P48751 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SLC4A3P48751 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
SLC4A3P48751 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SLC4A3P48751 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SLC4A3P48751 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SLC4A3P48751 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SLC4A3P48751 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SLC4A3P48751 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SLC4A3P48751 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SLC4A3P48751 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
SLC4A3P48751 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
SLC4A3P48751 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SLC4A3P48751 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SLC4A3P48751 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SLC4A3P48751 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SLC4A3P48751 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SLC4A3P48751 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SLC4A3P48751 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SLC4A3P48751 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SLC4A3P48751 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
SLC4A3P48751 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SLC4A3P48751 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SLC4A3P48751 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SLC4A3P48751 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SLC4A3P48751 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SLC4A3P48751 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SLC4A3P48751 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SLC4A3P48751 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SLC4A3P48751 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
SLC4A3P48751 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SLC4A3P48751 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SLC4A3P48751 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SLC4A3P48751 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SLC4A3P48751 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SLC4A3P48751 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SLC4A3P48751 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SLC4A3P48751 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SLC4A3P48751 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SLC4A3P48751 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SLC4A3P48751 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SLC4A3P48751 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SLC4A3P48751 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SLC4A3P48751 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
SLC4A3P48751 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SLC4A3P48751 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SLC4A3P48751 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
SLC4A3P48751 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SLC4A3P48751 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SLC4A3P48751 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SLC4A3P48751 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SLC4A3P48751 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SLC4A3P48751 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
SLC4A3P48751 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SLC4A3P48751 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SLC4A3P48751 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SLC4A3P48751 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SLC4A3P48751 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SLC4A3P48751 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SLC4A3P48751 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SLC4A3P48751 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SLC4A3P48751 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SLC4A3P48751 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SLC4A3P48751 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SLC4A3P48751 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SLC4A3P48751 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SLC4A3P48751 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SLC4A3P48751 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SLC4A3P48751 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SLC4A3P48751 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SLC4A3P48751 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SLC4A3P48751 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SLC4A3P48751 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SLC4A3P48751 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SLC4A3P48751 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
SLC4A3P48751 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SLC4A3P48751 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SLC4A3P48751 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SLC4A3P48751 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SLC4A3P48751 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SLC4A3P48751 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
SLC4A3P48751 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SLC4A3P48751 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SLC4A3P48751 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SLC4A3P48751 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SLC4A3P48751 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SLC4A3P48751 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SLC4A3P48751 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SLC4A3P48751 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
SLC4A3P48751 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SLC4A3P48751 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
SLC4A3P48751 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SLC4A3P48751 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SLC4A3P48751 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SLC4A3P48751 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms