Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GATA4P43694 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GATA4P43694 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GATA4P43694 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GATA4P43694 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GATA4P43694 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GATA4P43694 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GATA4P43694 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GATA4P43694 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GATA4P43694 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GATA4P43694 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATA4P43694 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATA4P43694 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATA4P43694 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATA4P43694 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GATA4P43694 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATA4P43694 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATA4P43694 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATA4P43694 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATA4P43694 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATA4P43694 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATA4P43694 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATA4P43694 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATA4P43694 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATA4P43694 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATA4P43694 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATA4P43694 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATA4P43694 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GATA4P43694 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATA4P43694 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATA4P43694 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATA4P43694 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATA4P43694 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATA4P43694 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATA4P43694 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATA4P43694 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATA4P43694 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATA4P43694 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATA4P43694 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATA4P43694 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATA4P43694 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATA4P43694 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATA4P43694 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATA4P43694 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATA4P43694 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATA4P43694 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATA4P43694 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATA4P43694 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATA4P43694 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATA4P43694 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATA4P43694 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATA4P43694 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATA4P43694 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATA4P43694 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GATA4P43694 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GATA4P43694 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATA4P43694 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATA4P43694 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATA4P43694 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATA4P43694 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATA4P43694 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATA4P43694 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATA4P43694 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATA4P43694 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATA4P43694 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATA4P43694 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATA4P43694 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATA4P43694 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATA4P43694 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATA4P43694 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATA4P43694 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATA4P43694 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATA4P43694 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATA4P43694 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATA4P43694 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GATA4P43694 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GATA4P43694 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GATA4P43694 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATA4P43694 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATA4P43694 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATA4P43694 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATA4P43694 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GATA4P43694 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GATA4P43694 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GATA4P43694 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GATA4P43694 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GATA4P43694 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GATA4P43694 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GATA4P43694 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GATA4P43694 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GATA4P43694 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GATA4P43694 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GATA4P43694 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GATA4P43694 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GATA4P43694 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GATA4P43694 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GATA4P43694 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GATA4P43694 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GATA4P43694 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GATA4P43694 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms