Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGM1P36871 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGM1P36871 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PGM1P36871 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGM1P36871 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGM1P36871 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PGM1P36871 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGM1P36871 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGM1P36871 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGM1P36871 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGM1P36871 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGM1P36871 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGM1P36871 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGM1P36871 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGM1P36871 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGM1P36871 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGM1P36871 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGM1P36871 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGM1P36871 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGM1P36871 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGM1P36871 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGM1P36871 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGM1P36871 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGM1P36871 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGM1P36871 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PGM1P36871 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGM1P36871 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGM1P36871 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PGM1P36871 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PGM1P36871 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PGM1P36871 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGM1P36871 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGM1P36871 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGM1P36871 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGM1P36871 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGM1P36871 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGM1P36871 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGM1P36871 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGM1P36871 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGM1P36871 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGM1P36871 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGM1P36871 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGM1P36871 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGM1P36871 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGM1P36871 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGM1P36871 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PGM1P36871 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGM1P36871 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGM1P36871 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGM1P36871 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGM1P36871 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PGM1P36871 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PGM1P36871 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PGM1P36871 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PGM1P36871 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PGM1P36871 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGM1P36871 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGM1P36871 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGM1P36871 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGM1P36871 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGM1P36871 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGM1P36871 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PGM1P36871 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PGM1P36871 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PGM1P36871 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGM1P36871 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGM1P36871 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGM1P36871 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGM1P36871 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGM1P36871 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGM1P36871 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGM1P36871 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGM1P36871 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGM1P36871 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGM1P36871 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGM1P36871 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGM1P36871 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PGM1P36871 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PGM1P36871 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PGM1P36871 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PGM1P36871 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PGM1P36871 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PGM1P36871 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PGM1P36871 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGM1P36871 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGM1P36871 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGM1P36871 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGM1P36871 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGM1P36871 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGM1P36871 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGM1P36871 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGM1P36871 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGM1P36871 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGM1P36871 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGM1P36871 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGM1P36871 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGM1P36871 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGM1P36871 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGM1P36871 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGM1P36871 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms