Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PGM1P36871 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
PGM1P36871 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PGM1P36871 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PGM1P36871 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PGM1P36871 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PGM1P36871 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PGM1P36871 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PGM1P36871 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PGM1P36871 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PGM1P36871 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PGM1P36871 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PGM1P36871 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PGM1P36871 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PGM1P36871 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PGM1P36871 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
PGM1P36871 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PGM1P36871 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PGM1P36871 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PGM1P36871 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PGM1P36871 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PGM1P36871 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PGM1P36871 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PGM1P36871 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PGM1P36871 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PGM1P36871 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PGM1P36871 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PGM1P36871 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PGM1P36871 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PGM1P36871 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PGM1P36871 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PGM1P36871 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PGM1P36871 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PGM1P36871 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PGM1P36871 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PGM1P36871 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PGM1P36871 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PGM1P36871 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PGM1P36871 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PGM1P36871 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PGM1P36871 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PGM1P36871 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PGM1P36871 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PGM1P36871 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PGM1P36871 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PGM1P36871 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PGM1P36871 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PGM1P36871 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PGM1P36871 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PGM1P36871 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PGM1P36871 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PGM1P36871 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PGM1P36871 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PGM1P36871 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PGM1P36871 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PGM1P36871 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PGM1P36871 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PGM1P36871 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PGM1P36871 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PGM1P36871 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PGM1P36871 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PGM1P36871 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PGM1P36871 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PGM1P36871 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PGM1P36871 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PGM1P36871 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PGM1P36871 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PGM1P36871 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PGM1P36871 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PGM1P36871 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PGM1P36871 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PGM1P36871 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PGM1P36871 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PGM1P36871 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
PGM1P36871 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PGM1P36871 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PGM1P36871 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PGM1P36871 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PGM1P36871 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PGM1P36871 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PGM1P36871 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PGM1P36871 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PGM1P36871 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PGM1P36871 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PGM1P36871 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PGM1P36871 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PGM1P36871 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PGM1P36871 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PGM1P36871 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PGM1P36871 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PGM1P36871 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PGM1P36871 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PGM1P36871 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PGM1P36871 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PGM1P36871 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PGM1P36871 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PGM1P36871 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PGM1P36871 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PGM1P36871 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PGM1P36871 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms