Protein–RNA interactions for Protein: P23258

TUBG1, Tubulin gamma-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBG1P23258 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBG1P23258 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBG1P23258 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBG1P23258 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBG1P23258 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBG1P23258 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBG1P23258 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBG1P23258 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBG1P23258 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBG1P23258 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBG1P23258 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBG1P23258 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBG1P23258 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBG1P23258 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBG1P23258 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBG1P23258 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBG1P23258 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBG1P23258 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBG1P23258 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBG1P23258 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBG1P23258 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBG1P23258 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBG1P23258 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBG1P23258 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBG1P23258 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBG1P23258 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBG1P23258 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBG1P23258 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBG1P23258 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBG1P23258 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBG1P23258 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBG1P23258 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBG1P23258 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBG1P23258 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBG1P23258 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBG1P23258 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBG1P23258 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBG1P23258 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBG1P23258 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBG1P23258 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBG1P23258 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBG1P23258 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBG1P23258 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBG1P23258 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBG1P23258 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBG1P23258 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBG1P23258 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBG1P23258 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBG1P23258 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBG1P23258 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBG1P23258 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBG1P23258 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBG1P23258 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBG1P23258 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBG1P23258 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBG1P23258 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBG1P23258 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBG1P23258 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBG1P23258 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBG1P23258 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBG1P23258 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBG1P23258 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBG1P23258 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBG1P23258 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBG1P23258 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBG1P23258 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBG1P23258 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBG1P23258 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBG1P23258 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBG1P23258 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBG1P23258 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBG1P23258 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBG1P23258 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBG1P23258 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBG1P23258 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBG1P23258 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBG1P23258 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBG1P23258 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBG1P23258 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBG1P23258 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBG1P23258 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBG1P23258 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBG1P23258 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBG1P23258 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBG1P23258 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBG1P23258 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBG1P23258 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBG1P23258 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBG1P23258 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBG1P23258 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBG1P23258 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBG1P23258 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBG1P23258 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBG1P23258 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBG1P23258 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBG1P23258 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBG1P23258 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBG1P23258 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBG1P23258 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBG1P23258 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms