Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LCP1P13796 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LCP1P13796 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LCP1P13796 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LCP1P13796 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LCP1P13796 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LCP1P13796 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LCP1P13796 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LCP1P13796 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LCP1P13796 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LCP1P13796 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LCP1P13796 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LCP1P13796 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LCP1P13796 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LCP1P13796 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LCP1P13796 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LCP1P13796 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LCP1P13796 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LCP1P13796 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LCP1P13796 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LCP1P13796 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LCP1P13796 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LCP1P13796 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LCP1P13796 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LCP1P13796 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LCP1P13796 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LCP1P13796 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LCP1P13796 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LCP1P13796 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LCP1P13796 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LCP1P13796 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LCP1P13796 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LCP1P13796 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LCP1P13796 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LCP1P13796 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LCP1P13796 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LCP1P13796 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LCP1P13796 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LCP1P13796 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LCP1P13796 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LCP1P13796 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LCP1P13796 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LCP1P13796 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LCP1P13796 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LCP1P13796 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LCP1P13796 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LCP1P13796 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LCP1P13796 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LCP1P13796 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LCP1P13796 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
LCP1P13796 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
LCP1P13796 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LCP1P13796 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LCP1P13796 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LCP1P13796 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LCP1P13796 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LCP1P13796 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LCP1P13796 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LCP1P13796 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LCP1P13796 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LCP1P13796 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LCP1P13796 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LCP1P13796 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LCP1P13796 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LCP1P13796 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LCP1P13796 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LCP1P13796 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LCP1P13796 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LCP1P13796 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LCP1P13796 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LCP1P13796 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LCP1P13796 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LCP1P13796 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LCP1P13796 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LCP1P13796 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LCP1P13796 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LCP1P13796 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LCP1P13796 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LCP1P13796 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LCP1P13796 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LCP1P13796 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LCP1P13796 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LCP1P13796 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LCP1P13796 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LCP1P13796 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LCP1P13796 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LCP1P13796 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LCP1P13796 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LCP1P13796 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LCP1P13796 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LCP1P13796 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LCP1P13796 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LCP1P13796 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LCP1P13796 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LCP1P13796 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LCP1P13796 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LCP1P13796 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LCP1P13796 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LCP1P13796 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LCP1P13796 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms