Protein–RNA interactions for Protein: P07358

C8B, Complement component C8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8BP07358 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C8BP07358 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C8BP07358 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
C8BP07358 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C8BP07358 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C8BP07358 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C8BP07358 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C8BP07358 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C8BP07358 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C8BP07358 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C8BP07358 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C8BP07358 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C8BP07358 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C8BP07358 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C8BP07358 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C8BP07358 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C8BP07358 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C8BP07358 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C8BP07358 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C8BP07358 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C8BP07358 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C8BP07358 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C8BP07358 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C8BP07358 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C8BP07358 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C8BP07358 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C8BP07358 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C8BP07358 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C8BP07358 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C8BP07358 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C8BP07358 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C8BP07358 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C8BP07358 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C8BP07358 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C8BP07358 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C8BP07358 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C8BP07358 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C8BP07358 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C8BP07358 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C8BP07358 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
C8BP07358 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C8BP07358 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C8BP07358 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C8BP07358 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C8BP07358 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
C8BP07358 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C8BP07358 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C8BP07358 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C8BP07358 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C8BP07358 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C8BP07358 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C8BP07358 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C8BP07358 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C8BP07358 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C8BP07358 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C8BP07358 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C8BP07358 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C8BP07358 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C8BP07358 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C8BP07358 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C8BP07358 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C8BP07358 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C8BP07358 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C8BP07358 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C8BP07358 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C8BP07358 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C8BP07358 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C8BP07358 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C8BP07358 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C8BP07358 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C8BP07358 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
C8BP07358 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C8BP07358 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C8BP07358 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C8BP07358 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C8BP07358 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C8BP07358 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C8BP07358 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C8BP07358 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C8BP07358 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C8BP07358 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C8BP07358 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C8BP07358 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C8BP07358 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C8BP07358 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C8BP07358 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C8BP07358 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C8BP07358 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C8BP07358 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C8BP07358 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C8BP07358 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C8BP07358 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C8BP07358 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C8BP07358 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C8BP07358 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C8BP07358 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C8BP07358 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C8BP07358 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C8BP07358 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
C8BP07358 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms