Protein–RNA interactions for Protein: P05114

HMGN1, Non-histone chromosomal protein HMG-14, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN1P05114 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGN1P05114 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGN1P05114 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGN1P05114 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGN1P05114 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGN1P05114 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGN1P05114 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGN1P05114 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGN1P05114 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGN1P05114 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGN1P05114 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGN1P05114 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGN1P05114 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGN1P05114 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGN1P05114 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGN1P05114 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGN1P05114 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGN1P05114 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGN1P05114 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGN1P05114 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGN1P05114 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGN1P05114 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGN1P05114 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGN1P05114 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGN1P05114 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGN1P05114 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGN1P05114 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGN1P05114 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGN1P05114 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGN1P05114 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGN1P05114 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGN1P05114 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGN1P05114 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGN1P05114 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGN1P05114 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGN1P05114 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGN1P05114 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGN1P05114 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
HMGN1P05114 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HMGN1P05114 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGN1P05114 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGN1P05114 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGN1P05114 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGN1P05114 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGN1P05114 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGN1P05114 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGN1P05114 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGN1P05114 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGN1P05114 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGN1P05114 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGN1P05114 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGN1P05114 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGN1P05114 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGN1P05114 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGN1P05114 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGN1P05114 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGN1P05114 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGN1P05114 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGN1P05114 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGN1P05114 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGN1P05114 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGN1P05114 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGN1P05114 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGN1P05114 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGN1P05114 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGN1P05114 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGN1P05114 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGN1P05114 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGN1P05114 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGN1P05114 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGN1P05114 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGN1P05114 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGN1P05114 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGN1P05114 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGN1P05114 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGN1P05114 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGN1P05114 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGN1P05114 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGN1P05114 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGN1P05114 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGN1P05114 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGN1P05114 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGN1P05114 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGN1P05114 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGN1P05114 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMGN1P05114 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGN1P05114 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGN1P05114 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGN1P05114 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGN1P05114 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGN1P05114 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGN1P05114 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGN1P05114 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGN1P05114 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGN1P05114 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGN1P05114 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGN1P05114 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGN1P05114 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGN1P05114 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGN1P05114 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms