Protein–RNA interactions for Protein: O95996

APC2, Adenomatous polyposis coli protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APC2O95996 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APC2O95996 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APC2O95996 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APC2O95996 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APC2O95996 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APC2O95996 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APC2O95996 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APC2O95996 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APC2O95996 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
APC2O95996 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APC2O95996 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APC2O95996 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APC2O95996 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APC2O95996 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APC2O95996 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
APC2O95996 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APC2O95996 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APC2O95996 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APC2O95996 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APC2O95996 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APC2O95996 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APC2O95996 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APC2O95996 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APC2O95996 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APC2O95996 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APC2O95996 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APC2O95996 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APC2O95996 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APC2O95996 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APC2O95996 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APC2O95996 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APC2O95996 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APC2O95996 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APC2O95996 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APC2O95996 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APC2O95996 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APC2O95996 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APC2O95996 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APC2O95996 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APC2O95996 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APC2O95996 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APC2O95996 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APC2O95996 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APC2O95996 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APC2O95996 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APC2O95996 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
APC2O95996 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APC2O95996 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APC2O95996 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APC2O95996 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APC2O95996 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APC2O95996 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APC2O95996 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APC2O95996 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APC2O95996 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
APC2O95996 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APC2O95996 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
APC2O95996 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APC2O95996 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APC2O95996 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APC2O95996 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APC2O95996 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APC2O95996 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APC2O95996 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APC2O95996 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APC2O95996 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APC2O95996 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APC2O95996 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APC2O95996 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APC2O95996 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APC2O95996 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APC2O95996 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APC2O95996 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APC2O95996 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APC2O95996 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APC2O95996 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APC2O95996 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APC2O95996 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APC2O95996 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
APC2O95996 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APC2O95996 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APC2O95996 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APC2O95996 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APC2O95996 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APC2O95996 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
APC2O95996 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APC2O95996 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APC2O95996 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APC2O95996 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APC2O95996 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APC2O95996 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APC2O95996 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APC2O95996 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APC2O95996 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
APC2O95996 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APC2O95996 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APC2O95996 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APC2O95996 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APC2O95996 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APC2O95996 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130 ms