Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RAB11FIP3O75154 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RAB11FIP3O75154 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RAB11FIP3O75154 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
RAB11FIP3O75154 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
RAB11FIP3O75154 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RAB11FIP3O75154 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
RAB11FIP3O75154 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RAB11FIP3O75154 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RAB11FIP3O75154 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RAB11FIP3O75154 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RAB11FIP3O75154 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
RAB11FIP3O75154 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
RAB11FIP3O75154 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RAB11FIP3O75154 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RAB11FIP3O75154 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RAB11FIP3O75154 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RAB11FIP3O75154 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RAB11FIP3O75154 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RAB11FIP3O75154 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RAB11FIP3O75154 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RAB11FIP3O75154 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RAB11FIP3O75154 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RAB11FIP3O75154 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RAB11FIP3O75154 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
RAB11FIP3O75154 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RAB11FIP3O75154 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
RAB11FIP3O75154 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
RAB11FIP3O75154 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RAB11FIP3O75154 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RAB11FIP3O75154 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RAB11FIP3O75154 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RAB11FIP3O75154 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RAB11FIP3O75154 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RAB11FIP3O75154 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RAB11FIP3O75154 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RAB11FIP3O75154 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RAB11FIP3O75154 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
RAB11FIP3O75154 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RAB11FIP3O75154 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
RAB11FIP3O75154 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
RAB11FIP3O75154 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
RAB11FIP3O75154 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RAB11FIP3O75154 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
RAB11FIP3O75154 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RAB11FIP3O75154 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RAB11FIP3O75154 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RAB11FIP3O75154 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RAB11FIP3O75154 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RAB11FIP3O75154 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RAB11FIP3O75154 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RAB11FIP3O75154 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RAB11FIP3O75154 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RAB11FIP3O75154 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RAB11FIP3O75154 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
RAB11FIP3O75154 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RAB11FIP3O75154 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
RAB11FIP3O75154 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RAB11FIP3O75154 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RAB11FIP3O75154 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
RAB11FIP3O75154 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
RAB11FIP3O75154 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
RAB11FIP3O75154 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RAB11FIP3O75154 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RAB11FIP3O75154 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
RAB11FIP3O75154 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
RAB11FIP3O75154 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RAB11FIP3O75154 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
RAB11FIP3O75154 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RAB11FIP3O75154 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RAB11FIP3O75154 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RAB11FIP3O75154 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RAB11FIP3O75154 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
RAB11FIP3O75154 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RAB11FIP3O75154 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RAB11FIP3O75154 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RAB11FIP3O75154 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RAB11FIP3O75154 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
RAB11FIP3O75154 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
RAB11FIP3O75154 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RAB11FIP3O75154 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RAB11FIP3O75154 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RAB11FIP3O75154 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RAB11FIP3O75154 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RAB11FIP3O75154 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RAB11FIP3O75154 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
RAB11FIP3O75154 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RAB11FIP3O75154 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
RAB11FIP3O75154 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RAB11FIP3O75154 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
RAB11FIP3O75154 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
RAB11FIP3O75154 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RAB11FIP3O75154 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RAB11FIP3O75154 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RAB11FIP3O75154 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RAB11FIP3O75154 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RAB11FIP3O75154 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RAB11FIP3O75154 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RAB11FIP3O75154 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RAB11FIP3O75154 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms