Protein–RNA interactions for Protein: O60353

FZD6, Frizzled-6, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD6O60353 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FZD6O60353 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FZD6O60353 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FZD6O60353 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FZD6O60353 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FZD6O60353 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FZD6O60353 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FZD6O60353 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FZD6O60353 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FZD6O60353 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FZD6O60353 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FZD6O60353 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FZD6O60353 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FZD6O60353 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
FZD6O60353 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FZD6O60353 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FZD6O60353 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FZD6O60353 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FZD6O60353 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FZD6O60353 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FZD6O60353 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
FZD6O60353 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
FZD6O60353 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FZD6O60353 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FZD6O60353 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
FZD6O60353 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
FZD6O60353 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FZD6O60353 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FZD6O60353 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FZD6O60353 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FZD6O60353 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FZD6O60353 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FZD6O60353 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FZD6O60353 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FZD6O60353 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FZD6O60353 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FZD6O60353 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FZD6O60353 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FZD6O60353 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FZD6O60353 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FZD6O60353 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FZD6O60353 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FZD6O60353 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FZD6O60353 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FZD6O60353 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FZD6O60353 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FZD6O60353 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FZD6O60353 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FZD6O60353 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FZD6O60353 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FZD6O60353 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FZD6O60353 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FZD6O60353 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FZD6O60353 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FZD6O60353 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FZD6O60353 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FZD6O60353 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FZD6O60353 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FZD6O60353 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FZD6O60353 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FZD6O60353 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FZD6O60353 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FZD6O60353 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FZD6O60353 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FZD6O60353 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FZD6O60353 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FZD6O60353 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FZD6O60353 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FZD6O60353 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FZD6O60353 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FZD6O60353 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FZD6O60353 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FZD6O60353 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FZD6O60353 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FZD6O60353 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FZD6O60353 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FZD6O60353 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FZD6O60353 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FZD6O60353 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FZD6O60353 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FZD6O60353 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FZD6O60353 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FZD6O60353 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FZD6O60353 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FZD6O60353 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FZD6O60353 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FZD6O60353 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FZD6O60353 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FZD6O60353 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FZD6O60353 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
FZD6O60353 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FZD6O60353 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FZD6O60353 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FZD6O60353 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FZD6O60353 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FZD6O60353 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FZD6O60353 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FZD6O60353 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FZD6O60353 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
FZD6O60353 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms