Protein–RNA interactions for Protein: O60287

URB1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URB1O60287 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
URB1O60287 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
URB1O60287 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
URB1O60287 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
URB1O60287 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
URB1O60287 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
URB1O60287 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
URB1O60287 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
URB1O60287 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
URB1O60287 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
URB1O60287 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
URB1O60287 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
URB1O60287 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
URB1O60287 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
URB1O60287 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
URB1O60287 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
URB1O60287 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
URB1O60287 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
URB1O60287 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
URB1O60287 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
URB1O60287 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
URB1O60287 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
URB1O60287 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
URB1O60287 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
URB1O60287 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
URB1O60287 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
URB1O60287 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
URB1O60287 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
URB1O60287 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
URB1O60287 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
URB1O60287 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
URB1O60287 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
URB1O60287 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
URB1O60287 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
URB1O60287 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
URB1O60287 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
URB1O60287 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
URB1O60287 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
URB1O60287 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
URB1O60287 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
URB1O60287 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
URB1O60287 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
URB1O60287 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
URB1O60287 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
URB1O60287 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
URB1O60287 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
URB1O60287 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
URB1O60287 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
URB1O60287 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
URB1O60287 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
URB1O60287 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
URB1O60287 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
URB1O60287 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
URB1O60287 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
URB1O60287 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
URB1O60287 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
URB1O60287 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
URB1O60287 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
URB1O60287 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
URB1O60287 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
URB1O60287 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
URB1O60287 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
URB1O60287 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
URB1O60287 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
URB1O60287 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
URB1O60287 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
URB1O60287 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
URB1O60287 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
URB1O60287 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
URB1O60287 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
URB1O60287 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
URB1O60287 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
URB1O60287 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
URB1O60287 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
URB1O60287 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
URB1O60287 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
URB1O60287 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
URB1O60287 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
URB1O60287 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
URB1O60287 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
URB1O60287 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
URB1O60287 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
URB1O60287 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
URB1O60287 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
URB1O60287 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
URB1O60287 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
URB1O60287 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
URB1O60287 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
URB1O60287 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
URB1O60287 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
URB1O60287 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
URB1O60287 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
URB1O60287 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
URB1O60287 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
URB1O60287 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
URB1O60287 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
URB1O60287 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
URB1O60287 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
URB1O60287 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
URB1O60287 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms