Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNAB3O43448 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNAB3O43448 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNAB3O43448 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNAB3O43448 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNAB3O43448 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNAB3O43448 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNAB3O43448 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNAB3O43448 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNAB3O43448 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNAB3O43448 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNAB3O43448 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNAB3O43448 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNAB3O43448 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNAB3O43448 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNAB3O43448 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNAB3O43448 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNAB3O43448 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNAB3O43448 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNAB3O43448 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNAB3O43448 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNAB3O43448 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNAB3O43448 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNAB3O43448 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNAB3O43448 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNAB3O43448 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNAB3O43448 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNAB3O43448 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNAB3O43448 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNAB3O43448 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNAB3O43448 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KCNAB3O43448 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
KCNAB3O43448 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNAB3O43448 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNAB3O43448 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNAB3O43448 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNAB3O43448 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNAB3O43448 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNAB3O43448 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNAB3O43448 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNAB3O43448 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNAB3O43448 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNAB3O43448 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNAB3O43448 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNAB3O43448 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNAB3O43448 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNAB3O43448 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNAB3O43448 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNAB3O43448 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNAB3O43448 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNAB3O43448 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KCNAB3O43448 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNAB3O43448 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNAB3O43448 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNAB3O43448 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNAB3O43448 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNAB3O43448 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNAB3O43448 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNAB3O43448 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNAB3O43448 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNAB3O43448 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNAB3O43448 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNAB3O43448 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNAB3O43448 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNAB3O43448 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNAB3O43448 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNAB3O43448 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNAB3O43448 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNAB3O43448 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNAB3O43448 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNAB3O43448 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNAB3O43448 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNAB3O43448 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNAB3O43448 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNAB3O43448 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNAB3O43448 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNAB3O43448 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNAB3O43448 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNAB3O43448 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNAB3O43448 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNAB3O43448 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNAB3O43448 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNAB3O43448 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNAB3O43448 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNAB3O43448 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNAB3O43448 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNAB3O43448 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNAB3O43448 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNAB3O43448 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNAB3O43448 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNAB3O43448 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNAB3O43448 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KCNAB3O43448 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNAB3O43448 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNAB3O43448 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNAB3O43448 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNAB3O43448 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNAB3O43448 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNAB3O43448 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNAB3O43448 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms