Protein–RNA interactions for Protein: O15499

GSC2, Homeobox protein goosecoid-2, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSC2O15499 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GSC2O15499 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GSC2O15499 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GSC2O15499 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GSC2O15499 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GSC2O15499 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GSC2O15499 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GSC2O15499 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GSC2O15499 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GSC2O15499 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GSC2O15499 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GSC2O15499 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GSC2O15499 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GSC2O15499 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GSC2O15499 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GSC2O15499 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSC2O15499 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSC2O15499 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSC2O15499 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSC2O15499 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSC2O15499 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSC2O15499 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSC2O15499 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSC2O15499 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GSC2O15499 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GSC2O15499 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSC2O15499 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSC2O15499 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GSC2O15499 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GSC2O15499 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GSC2O15499 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GSC2O15499 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GSC2O15499 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GSC2O15499 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GSC2O15499 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GSC2O15499 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GSC2O15499 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GSC2O15499 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GSC2O15499 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GSC2O15499 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GSC2O15499 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GSC2O15499 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GSC2O15499 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GSC2O15499 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GSC2O15499 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GSC2O15499 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GSC2O15499 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GSC2O15499 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GSC2O15499 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GSC2O15499 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSC2O15499 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSC2O15499 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSC2O15499 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSC2O15499 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSC2O15499 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSC2O15499 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSC2O15499 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GSC2O15499 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GSC2O15499 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GSC2O15499 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GSC2O15499 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GSC2O15499 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GSC2O15499 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GSC2O15499 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GSC2O15499 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSC2O15499 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GSC2O15499 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GSC2O15499 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GSC2O15499 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GSC2O15499 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GSC2O15499 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GSC2O15499 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GSC2O15499 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GSC2O15499 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GSC2O15499 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GSC2O15499 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GSC2O15499 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GSC2O15499 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GSC2O15499 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GSC2O15499 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GSC2O15499 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GSC2O15499 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GSC2O15499 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GSC2O15499 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GSC2O15499 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GSC2O15499 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GSC2O15499 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GSC2O15499 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GSC2O15499 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GSC2O15499 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GSC2O15499 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GSC2O15499 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GSC2O15499 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GSC2O15499 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GSC2O15499 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GSC2O15499 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GSC2O15499 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GSC2O15499 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GSC2O15499 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GSC2O15499 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms