Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC69A6NI79 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC69A6NI79 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC69A6NI79 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC69A6NI79 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC69A6NI79 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC69A6NI79 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC69A6NI79 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.53
CCDC69A6NI79 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC69A6NI79 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC69A6NI79 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC69A6NI79 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC69A6NI79 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC69A6NI79 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC69A6NI79 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC69A6NI79 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC69A6NI79 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC69A6NI79 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC69A6NI79 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC69A6NI79 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC69A6NI79 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC69A6NI79 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC69A6NI79 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC69A6NI79 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC69A6NI79 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC69A6NI79 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC69A6NI79 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC69A6NI79 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC69A6NI79 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC69A6NI79 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC69A6NI79 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC69A6NI79 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC69A6NI79 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC69A6NI79 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CCDC69A6NI79 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC69A6NI79 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC69A6NI79 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC69A6NI79 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC69A6NI79 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC69A6NI79 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC69A6NI79 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC69A6NI79 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC69A6NI79 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC69A6NI79 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC69A6NI79 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC69A6NI79 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC69A6NI79 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC69A6NI79 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC69A6NI79 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CCDC69A6NI79 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CCDC69A6NI79 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CCDC69A6NI79 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC69A6NI79 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC69A6NI79 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC69A6NI79 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC69A6NI79 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC69A6NI79 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC69A6NI79 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC69A6NI79 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC69A6NI79 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC69A6NI79 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC69A6NI79 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC69A6NI79 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC69A6NI79 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC69A6NI79 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC69A6NI79 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC69A6NI79 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC69A6NI79 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC69A6NI79 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC69A6NI79 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC69A6NI79 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC69A6NI79 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC69A6NI79 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC69A6NI79 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC69A6NI79 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC69A6NI79 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC69A6NI79 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC69A6NI79 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC69A6NI79 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC69A6NI79 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC69A6NI79 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC69A6NI79 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC69A6NI79 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC69A6NI79 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC69A6NI79 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC69A6NI79 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC69A6NI79 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC69A6NI79 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC69A6NI79 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC69A6NI79 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC69A6NI79 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC69A6NI79 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC69A6NI79 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC69A6NI79 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC69A6NI79 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC69A6NI79 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC69A6NI79 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC69A6NI79 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC69A6NI79 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC69A6NI79 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms