Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 FHL3-203ENST00000477194 1091 ntTSL 251.3■■■■■ 5.82e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.085e-10■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.063e-8■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 GUSB-205ENST00000447929 1983 ntTSL 337.36■■■■□ 3.573e-8■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 NUCB2-212ENST00000531172 514 ntTSL 337.13■■■■□ 3.532e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 GUSB-203ENST00000430730 1859 ntTSL 537.1■■■■□ 3.533e-8■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 UBP1-205ENST00000456378 581 ntTSL 436.41■■■■□ 3.425e-10■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 GUSB-204ENST00000446111 933 ntTSL 1 (best)36.1■■■■□ 3.373e-8■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 PDGFA-205ENST00000426681 357 ntTSL 536.05■■■■□ 3.362e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 TOLLIP-204ENST00000527085 595 ntTSL 535.12■■■■□ 3.212e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 RNF111-205ENST00000559160 900 ntTSL 335.08■■■■□ 3.212e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 MKNK2-203ENST00000585667 870 ntTSL 534.52■■■■□ 3.121e-13■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 NUCB2-203ENST00000525637 356 ntTSL 332.77■■■□□ 2.842e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.842e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 RSPRY1-208ENST00000564435 743 ntTSL 531.9■■■□□ 2.72e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 PDGFA-204ENST00000405692 663 ntTSL 531.86■■■□□ 2.692e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 BCL6-205ENST00000438077 709 ntTSL 331.81■■■□□ 2.682e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 FBXW2-201ENST00000453291 1079 ntTSL 531.67■■■□□ 2.662e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 SEMA7A-204ENST00000567345 674 ntTSL 431.41■■■□□ 2.622e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.583e-8■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 ADCY7-215ENST00000570187 1320 ntTSL 231.15■■■□□ 2.582e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 FBXW2-203ENST00000476481 661 ntTSL 330.41■■■□□ 2.462e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 TAF7-203ENST00000624761 603 ntTSL 430.39■■■□□ 2.452e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 RSPRY1-206ENST00000562959 548 ntTSL 430.18■■■□□ 2.422e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 DCAF16-203ENST00000507768 757 ntTSL 230.1■■■□□ 2.412e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 NDUFA3-213ENST00000484103 541 ntTSL 1 (best)29.85■■■□□ 2.372e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.362e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 RSPRY1-204ENST00000562439 692 ntTSL 529.13■■■□□ 2.252e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 FHL3-202ENST00000475084 882 ntTSL 528.92■■■□□ 2.222e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.21e-8■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 YIF1A-212ENST00000528575 532 ntTSL 328.74■■■□□ 2.193e-8■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 RSPRY1-210ENST00000566352 1241 ntTSL 1 (best)28.69■■■□□ 2.182e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 THOP1-208ENST00000587468 671 ntTSL 228.49■■■□□ 2.151e-8■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.932e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.892e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 THRAP3-204ENST00000478853 380 ntAPPRIS ALT2 TSL 226.59■■□□□ 1.852e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 DCAF16-202ENST00000507731 533 ntTSL 226.55■■□□□ 1.842e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.815e-10■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 IDH3B-209ENST00000488299 1620 ntTSL 226.11■■□□□ 1.775e-10■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 RNF111-208ENST00000559757 541 ntTSL 426.04■■□□□ 1.762e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.742e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 RSPRY1-211ENST00000568505 654 ntTSL 525.87■■□□□ 1.732e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 FHL3-205ENST00000485803 1468 ntTSL 1 (best)25.84■■□□□ 1.732e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 FBXW2-202ENST00000474117 1062 ntTSL 525.6■■□□□ 1.692e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.662e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 GSE1-206ENST00000438180 1741 ntTSL 1 (best)25.2■■□□□ 1.622e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 NDUFA3-206ENST00000419113 654 ntTSL 325.12■■□□□ 1.612e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.612e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 CHD7-204ENST00000526846 500 ntTSL 224.8■■□□□ 1.562e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.552e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 NUCB2-215ENST00000533511 544 ntTSL 324.72■■□□□ 1.552e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.485e-10■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.475e-10■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.465e-10■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 YIF1A-204ENST00000431556 619 ntTSL 224.05■■□□□ 1.443e-8■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 SDF4-204ENST00000459994 604 ntTSL 523.99■■□□□ 1.432e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.372e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.352e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 NUCB2-207ENST00000528644 530 ntTSL 423.43■■□□□ 1.342e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 NDUFA3-205ENST00000417903 666 ntTSL 323.19■■□□□ 1.32e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.292e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 JARID2-203ENST00000474854 520 ntTSL 323.07■■□□□ 1.282e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.272e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 AES-205ENST00000586003 367 ntTSL 222.9■■□□□ 1.262e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 PSMB7-206ENST00000498485 967 ntTSL 522.63■■□□□ 1.212e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 IDH3B-207ENST00000477689 608 ntTSL 522.61■■□□□ 1.215e-10■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 AES-204ENST00000585782 505 ntTSL 222.57■■□□□ 1.22e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 12e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 RGL2-238ENST00000437840 2687 ntTSL 1 (best)21.2■□□□□ 0.982e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.82e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.782e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 ANP32B-202ENST00000473205 687 ntTSL 319.88■□□□□ 0.772e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 TOLLIP-213ENST00000532551 576 ntTSL 219.74■□□□□ 0.752e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 NSD2-225ENST00000514329 851 ntTSL 319.71■□□□□ 0.752e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 GSE1-210ENST00000495192 618 ntTSL 219.47■□□□□ 0.712e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 THRAP3-203ENST00000469141 3339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.582e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 NUCB2-216ENST00000533738 534 ntTSL 1 (best)18.28■□□□□ 0.522e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 DCAF16-201ENST00000382247 4548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.452e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 NDUFA3-208ENST00000422029 694 ntTSL 317.79■□□□□ 0.442e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 DENND4B-202ENST00000368646 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.42■□□□□ 0.382e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 NSD2-223ENST00000513726 648 ntTSL 317.39■□□□□ 0.372e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.332e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 NSD2-210ENST00000482415 3602 ntTSL 1 (best)17.13■□□□□ 0.332e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 NDUFA3-209ENST00000451517 445 ntTSL 1 (best)17.07■□□□□ 0.322e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 NDUFA3-210ENST00000471292 646 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.322e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 PLOD1-201ENST00000196061 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.312e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 IDH3B-211ENST00000492240 964 ntTSL 516.72■□□□□ 0.275e-10■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 KDM6B-204ENST00000571047 362 ntTSL 516.65■□□□□ 0.262e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 IDH3B-204ENST00000466494 677 ntTSL 216.26■□□□□ 0.195e-10■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.162e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 PLOD1-209ENST00000491536 639 ntTSL 315.65■□□□□ 0.12e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.092e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.082e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 PSMB7-201ENST00000259457 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.072e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.072e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -02e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 RNF111-202ENST00000557998 4803 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.012e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 THRAP3-201ENST00000354618 4432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.112e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 GSE1-207ENST00000469381 5885 ntTSL 214.26□□□□□ -0.132e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 NDUFA3-202ENST00000391762 435 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.132e-6■■■■□ 19.8
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