RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446111.1

GUSB-204, Transcript of glucuronidase beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GUSB, Length 933 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GUSB-204ENST00000446111 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.29■■■■■ 6.76
GUSB-204ENST00000446111 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.02■■■■■ 5.76
GUSB-204ENST00000446111 ABCC9O60706 1549 aa49.92■■■■■ 5.58
GUSB-204ENST00000446111 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.07■■■■■ 5.29
GUSB-204ENST00000446111 NACADO15069 1562 aa47.99■■■■■ 5.27
GUSB-204ENST00000446111 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.84■■■■■ 5.25
GUSB-204ENST00000446111 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.72■■■■■ 5.23
GUSB-204ENST00000446111 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.71■■■■■ 5.23
GUSB-204ENST00000446111 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.46■■■■■ 5.19
GUSB-204ENST00000446111 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.87■■■■■ 5.09
GUSB-204ENST00000446111 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.58■■■■■ 5.05
GUSB-204ENST00000446111 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.52■■■■■ 5.04
GUSB-204ENST00000446111 SCRIBQ14160 1630 aa46.48■■■■■ 5.03
GUSB-204ENST00000446111 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.19■■■■■ 4.99
GUSB-204ENST00000446111 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.79■■■■■ 4.92
GUSB-204ENST00000446111 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.36■■■■■ 4.85
GUSB-204ENST00000446111 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.17■■■■■ 4.82
GUSB-204ENST00000446111 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.9■■■■■ 4.78
GUSB-204ENST00000446111 SMARCA4P51532 1647 aa44.47■■■■■ 4.71
GUSB-204ENST00000446111 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.46■■■■■ 4.71
GUSB-204ENST00000446111 NCAPD3P42695 1498 aa44.26■■■■■ 4.68
GUSB-204ENST00000446111 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.25■■■■■ 4.67
GUSB-204ENST00000446111 SMARCA2P51531 1590 aa44.25■■■■■ 4.67
GUSB-204ENST00000446111 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.11■■■■■ 4.65
GUSB-204ENST00000446111 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.07■■■■■ 4.65
GUSB-204ENST00000446111 HMGXB3Q12766 1538 aa44.07■■■■■ 4.65
GUSB-204ENST00000446111 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.91■■■■■ 4.62
GUSB-204ENST00000446111 WIZO95785 1651 aa43.62■■■■■ 4.57
GUSB-204ENST00000446111 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.59■■■■■ 4.57
GUSB-204ENST00000446111 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.22■■■■■ 4.51
GUSB-204ENST00000446111 NESP48681 1621 aa43.15■■■■■ 4.5
GUSB-204ENST00000446111 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.13■■■■■ 4.5
GUSB-204ENST00000446111 ERCC6Q03468 1493 aa43.1■■■■■ 4.49
GUSB-204ENST00000446111 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.95■■■■■ 4.47
GUSB-204ENST00000446111 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.84■■■■■ 4.45
GUSB-204ENST00000446111 CUX2O14529 1486 aa42.69■■■■■ 4.42
GUSB-204ENST00000446111 CFTRP13569 1480 aa42.68■■■■■ 4.42
GUSB-204ENST00000446111 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.66■■■■■ 4.42
GUSB-204ENST00000446111 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.66■■■■■ 4.42
GUSB-204ENST00000446111 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.57■■■■■ 4.41
GUSB-204ENST00000446111 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.47■■■■■ 4.39
GUSB-204ENST00000446111 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.45■■■■■ 4.39
GUSB-204ENST00000446111 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.4■■■■■ 4.38
GUSB-204ENST00000446111 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.38■■■■■ 4.37
GUSB-204ENST00000446111 PRDM2Q13029 1718 aa42.37■■■■■ 4.37
GUSB-204ENST00000446111 WDR62O43379 1518 aa42.26■■■■■ 4.36
GUSB-204ENST00000446111 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.01■■■■■ 4.32
GUSB-204ENST00000446111 ABCC8Q09428 1581 aa41.83■■■■■ 4.29
GUSB-204ENST00000446111 TOPBP1Q92547 1522 aa41.77■■■■■ 4.28
GUSB-204ENST00000446111 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.74■■■■■ 4.27
GUSB-204ENST00000446111 IFT140Q96RY7 1462 aa41.57■■■■■ 4.25
GUSB-204ENST00000446111 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.41■■■■■ 4.22
GUSB-204ENST00000446111 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.4■■■■■ 4.22
GUSB-204ENST00000446111 CUX1P39880 1505 aa41.39■■■■■ 4.22
GUSB-204ENST00000446111 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.3■■■■■ 4.2
GUSB-204ENST00000446111 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.3■■■■■ 4.2
GUSB-204ENST00000446111 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.3■■■■■ 4.2
GUSB-204ENST00000446111 SOGA1O94964 1423 aa41.23■■■■■ 4.19
GUSB-204ENST00000446111 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.2■■■■■ 4.19
GUSB-204ENST00000446111 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.18■■■■■ 4.18
GUSB-204ENST00000446111 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.15■■■■■ 4.18
GUSB-204ENST00000446111 WDR97A6NE52 1622 aa41.07■■■■■ 4.17
GUSB-204ENST00000446111 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.06■■■■■ 4.16
GUSB-204ENST00000446111 TOP2BQ02880 1626 aa41.06■■■■■ 4.16
GUSB-204ENST00000446111 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.05■■■■■ 4.16
GUSB-204ENST00000446111 SYNJ1O43426 1573 aa41■■■■■ 4.15
GUSB-204ENST00000446111 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.99■■■■■ 4.15
GUSB-204ENST00000446111 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.92■■■■■ 4.14
GUSB-204ENST00000446111 OSCARQ8IYS5 282 aa40.86■■■■■ 4.13
GUSB-204ENST00000446111 GRIN2BQ13224 1484 aa40.79■■■■■ 4.12
GUSB-204ENST00000446111 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.77■■■■■ 4.12
GUSB-204ENST00000446111 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.75■■■■■ 4.11
GUSB-204ENST00000446111 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.73■■■■■ 4.11
GUSB-204ENST00000446111 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.71■■■■■ 4.11
GUSB-204ENST00000446111 PBRM1Q86U86 1689 aa40.68■■■■■ 4.1
GUSB-204ENST00000446111 CHD1O14646 1710 aa40.66■■■■■ 4.1
GUSB-204ENST00000446111 FBLN2P98095 1184 aa40.61■■■■■ 4.09
GUSB-204ENST00000446111 SYNJ2O15056 1496 aa40.54■■■■■ 4.08
GUSB-204ENST00000446111 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.51■■■■■ 4.08
GUSB-204ENST00000446111 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.44■■■■■ 4.06
GUSB-204ENST00000446111 ADAMTS12P58397 1594 aa40.38■■■■■ 4.05
GUSB-204ENST00000446111 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.32■■■■■ 4.04
GUSB-204ENST00000446111 KIF27Q86VH2 1401 aa40.31■■■■■ 4.04
GUSB-204ENST00000446111 GRIN2AQ12879 1464 aa40.26■■■■■ 4.03
GUSB-204ENST00000446111 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.25■■■■■ 4.03
GUSB-204ENST00000446111 ARHGEF11O15085 1522 aa40.21■■■■■ 4.03
GUSB-204ENST00000446111 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.2■■■■■ 4.03
GUSB-204ENST00000446111 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.2■■■■■ 4.03
GUSB-204ENST00000446111 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.2■■■■■ 4.03
GUSB-204ENST00000446111 TRIM41Q8WV44 630 aa40.09■■■■■ 4.01
GUSB-204ENST00000446111 IGF1RP08069 1367 aa40.09■■■■■ 4.01
GUSB-204ENST00000446111 NUP160Q12769 1436 aa40.08■■■■■ 4.01
GUSB-204ENST00000446111 CUL7Q14999 1698 aa40.07■■■■■ 4
GUSB-204ENST00000446111 CEP170Q5SW79 1584 aa40.03■■■■■ 4
GUSB-204ENST00000446111 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.87■■■■□ 3.97
GUSB-204ENST00000446111 ARAP1Q96P48 1450 aa39.86■■■■□ 3.97
GUSB-204ENST00000446111 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.8■■■■□ 3.96
GUSB-204ENST00000446111 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.79■■■■□ 3.96
GUSB-204ENST00000446111 SHROOM2Q13796 1616 aa39.79■■■■□ 3.96
GUSB-204ENST00000446111 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa39.69■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.6 ms