RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426681.2

PDGFA-205, Transcript of platelet derived growth factor subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene PDGFA, Length 357 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFA-205ENST00000426681 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.9■■■■■ 6.7
PDGFA-205ENST00000426681 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.54■■■■■ 5.68
PDGFA-205ENST00000426681 ABCC9O60706 1549 aa49.27■■■■■ 5.48
PDGFA-205ENST00000426681 NACADO15069 1562 aa47.5■■■■■ 5.19
PDGFA-205ENST00000426681 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.49■■■■■ 5.19
PDGFA-205ENST00000426681 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.41■■■■■ 5.18
PDGFA-205ENST00000426681 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.41■■■■■ 5.18
PDGFA-205ENST00000426681 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.3■■■■■ 5.16
PDGFA-205ENST00000426681 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.13■■■■■ 5.14
PDGFA-205ENST00000426681 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.41■■■■■ 5.02
PDGFA-205ENST00000426681 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.06■■■■■ 4.96
PDGFA-205ENST00000426681 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.06■■■■■ 4.96
PDGFA-205ENST00000426681 SCRIBQ14160 1630 aa46.05■■■■■ 4.96
PDGFA-205ENST00000426681 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.63■■■■■ 4.9
PDGFA-205ENST00000426681 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.16■■■■■ 4.82
PDGFA-205ENST00000426681 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.82■■■■■ 4.77
PDGFA-205ENST00000426681 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.61■■■■■ 4.73
PDGFA-205ENST00000426681 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.29■■■■■ 4.68
PDGFA-205ENST00000426681 SMARCA4P51532 1647 aa44.11■■■■■ 4.65
PDGFA-205ENST00000426681 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.09■■■■■ 4.65
PDGFA-205ENST00000426681 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.85■■■■■ 4.61
PDGFA-205ENST00000426681 NCAPD3P42695 1498 aa43.84■■■■■ 4.61
PDGFA-205ENST00000426681 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.83■■■■■ 4.61
PDGFA-205ENST00000426681 SMARCA2P51531 1590 aa43.81■■■■■ 4.6
PDGFA-205ENST00000426681 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.72■■■■■ 4.59
PDGFA-205ENST00000426681 HMGXB3Q12766 1538 aa43.61■■■■■ 4.57
PDGFA-205ENST00000426681 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.47■■■■■ 4.55
PDGFA-205ENST00000426681 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.39■■■■■ 4.54
PDGFA-205ENST00000426681 WIZO95785 1651 aa43.35■■■■■ 4.53
PDGFA-205ENST00000426681 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.92■■■■■ 4.46
PDGFA-205ENST00000426681 NESP48681 1621 aa42.68■■■■■ 4.42
PDGFA-205ENST00000426681 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.64■■■■■ 4.42
PDGFA-205ENST00000426681 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.55■■■■■ 4.4
PDGFA-205ENST00000426681 ERCC6Q03468 1493 aa42.45■■■■■ 4.39
PDGFA-205ENST00000426681 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.43■■■■■ 4.38
PDGFA-205ENST00000426681 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.35■■■■■ 4.37
PDGFA-205ENST00000426681 CFTRP13569 1480 aa42.33■■■■■ 4.37
PDGFA-205ENST00000426681 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.32■■■■■ 4.37
PDGFA-205ENST00000426681 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.18■■■■■ 4.34
PDGFA-205ENST00000426681 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.04■■■■■ 4.32
PDGFA-205ENST00000426681 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.03■■■■■ 4.32
PDGFA-205ENST00000426681 CUX2O14529 1486 aa42.02■■■■■ 4.32
PDGFA-205ENST00000426681 PRDM2Q13029 1718 aa42■■■■■ 4.31
PDGFA-205ENST00000426681 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.96■■■■■ 4.31
PDGFA-205ENST00000426681 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.89■■■■■ 4.3
PDGFA-205ENST00000426681 WDR62O43379 1518 aa41.76■■■■■ 4.28
PDGFA-205ENST00000426681 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.61■■■■■ 4.25
PDGFA-205ENST00000426681 ABCC8Q09428 1581 aa41.42■■■■■ 4.22
PDGFA-205ENST00000426681 TOPBP1Q92547 1522 aa41.39■■■■■ 4.22
PDGFA-205ENST00000426681 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.34■■■■■ 4.21
PDGFA-205ENST00000426681 CUX1P39880 1505 aa41.12■■■■■ 4.17
PDGFA-205ENST00000426681 IFT140Q96RY7 1462 aa41.1■■■■■ 4.17
PDGFA-205ENST00000426681 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.03■■■■■ 4.16
PDGFA-205ENST00000426681 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.95■■■■■ 4.15
PDGFA-205ENST00000426681 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.93■■■■■ 4.14
PDGFA-205ENST00000426681 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.89■■■■■ 4.14
PDGFA-205ENST00000426681 SOGA1O94964 1423 aa40.88■■■■■ 4.13
PDGFA-205ENST00000426681 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.88■■■■■ 4.13
PDGFA-205ENST00000426681 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.83■■■■■ 4.13
PDGFA-205ENST00000426681 TOP2BQ02880 1626 aa40.81■■■■■ 4.12
PDGFA-205ENST00000426681 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.8■■■■■ 4.12
PDGFA-205ENST00000426681 SYNJ1O43426 1573 aa40.78■■■■■ 4.12
PDGFA-205ENST00000426681 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.71■■■■■ 4.11
PDGFA-205ENST00000426681 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.67■■■■■ 4.1
PDGFA-205ENST00000426681 WDR97A6NE52 1622 aa40.64■■■■■ 4.1
PDGFA-205ENST00000426681 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
PDGFA-205ENST00000426681 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.61■■■■■ 4.09
PDGFA-205ENST00000426681 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.59■■■■■ 4.09
PDGFA-205ENST00000426681 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.4■■■■■ 4.06
PDGFA-205ENST00000426681 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.4■■■■■ 4.06
PDGFA-205ENST00000426681 GRIN2BQ13224 1484 aa40.39■■■■■ 4.06
PDGFA-205ENST00000426681 OSCARQ8IYS5 282 aa40.31■■■■■ 4.04
PDGFA-205ENST00000426681 PBRM1Q86U86 1689 aa40.29■■■■■ 4.04
PDGFA-205ENST00000426681 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.28■■■■■ 4.04
PDGFA-205ENST00000426681 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.28■■■■■ 4.04
PDGFA-205ENST00000426681 CHD1O14646 1710 aa40.18■■■■■ 4.02
PDGFA-205ENST00000426681 FBLN2P98095 1184 aa40.12■■■■■ 4.01
PDGFA-205ENST00000426681 SYNJ2O15056 1496 aa40.12■■■■■ 4.01
PDGFA-205ENST00000426681 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.11■■■■■ 4.01
PDGFA-205ENST00000426681 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.07■■■■■ 4.01
PDGFA-205ENST00000426681 KIF27Q86VH2 1401 aa40.04■■■■■ 4
PDGFA-205ENST00000426681 TRIM41Q8WV44 630 aa40■■■■□ 3.99
PDGFA-205ENST00000426681 ADAMTS12P58397 1594 aa39.99■■■■□ 3.99
PDGFA-205ENST00000426681 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.95■■■■□ 3.99
PDGFA-205ENST00000426681 IGF1RP08069 1367 aa39.89■■■■□ 3.98
PDGFA-205ENST00000426681 GRIN2AQ12879 1464 aa39.86■■■■□ 3.97
PDGFA-205ENST00000426681 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.78■■■■□ 3.96
PDGFA-205ENST00000426681 CUL7Q14999 1698 aa39.75■■■■□ 3.95
PDGFA-205ENST00000426681 NUP160Q12769 1436 aa39.7■■■■□ 3.95
PDGFA-205ENST00000426681 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.69■■■■□ 3.94
PDGFA-205ENST00000426681 CEP170Q5SW79 1584 aa39.65■■■■□ 3.94
PDGFA-205ENST00000426681 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.63■■■■□ 3.93
PDGFA-205ENST00000426681 ARHGEF11O15085 1522 aa39.62■■■■□ 3.93
PDGFA-205ENST00000426681 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.61■■■■□ 3.93
PDGFA-205ENST00000426681 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.61■■■■□ 3.93
PDGFA-205ENST00000426681 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.61■■■■□ 3.93
PDGFA-205ENST00000426681 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.61■■■■□ 3.93
PDGFA-205ENST00000426681 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.41■■■■□ 3.9
PDGFA-205ENST00000426681 SHROOM2Q13796 1616 aa39.4■■■■□ 3.9
PDGFA-205ENST00000426681 EEA1Q15075 1411 aa39.37■■■■□ 3.89
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