RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531172.5

NUCB2-212, Transcript of nucleobindin 2, humanhuman

TSL 3

Gene NUCB2, Length 514 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2-212ENST00000531172 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.73■■■■■ 6.99
NUCB2-212ENST00000531172 ABCC9O60706 1549 aa53.17■■■■■ 6.1
NUCB2-212ENST00000531172 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.77■■■■■ 6.04
NUCB2-212ENST00000531172 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.47■■■■■ 5.67
NUCB2-212ENST00000531172 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.06■■■■■ 5.6
NUCB2-212ENST00000531172 NACADO15069 1562 aa50.03■■■■■ 5.6
NUCB2-212ENST00000531172 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.02■■■■■ 5.6
NUCB2-212ENST00000531172 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.53■■■■■ 5.52
NUCB2-212ENST00000531172 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.17■■■■■ 5.46
NUCB2-212ENST00000531172 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.14■■■■■ 5.46
NUCB2-212ENST00000531172 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.83■■■■■ 5.41
NUCB2-212ENST00000531172 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.56■■■■■ 5.36
NUCB2-212ENST00000531172 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.44■■■■■ 5.35
NUCB2-212ENST00000531172 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.25■■■■■ 5.31
NUCB2-212ENST00000531172 SCRIBQ14160 1630 aa48.15■■■■■ 5.3
NUCB2-212ENST00000531172 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.94■■■■■ 5.26
NUCB2-212ENST00000531172 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.92■■■■■ 5.26
NUCB2-212ENST00000531172 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.76■■■■■ 5.24
NUCB2-212ENST00000531172 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.24■■■■■ 4.99
NUCB2-212ENST00000531172 NCAPD3P42695 1498 aa46.17■■■■■ 4.98
NUCB2-212ENST00000531172 ERCC6Q03468 1493 aa46.04■■■■■ 4.96
NUCB2-212ENST00000531172 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46■■■■■ 4.95
NUCB2-212ENST00000531172 CUX2O14529 1486 aa45.91■■■■■ 4.94
NUCB2-212ENST00000531172 SMARCA2P51531 1590 aa45.9■■■■■ 4.94
NUCB2-212ENST00000531172 SMARCA4P51532 1647 aa45.85■■■■■ 4.93
NUCB2-212ENST00000531172 HMGXB3Q12766 1538 aa45.77■■■■■ 4.92
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NUCB2-212ENST00000531172 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.61■■■■■ 4.89
NUCB2-212ENST00000531172 NESP48681 1621 aa45.52■■■■■ 4.88
NUCB2-212ENST00000531172 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.34■■■■■ 4.85
NUCB2-212ENST00000531172 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.23■■■■■ 4.83
NUCB2-212ENST00000531172 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.2■■■■■ 4.83
NUCB2-212ENST00000531172 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.06■■■■■ 4.8
NUCB2-212ENST00000531172 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.03■■■■■ 4.8
NUCB2-212ENST00000531172 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.89■■■■■ 4.78
NUCB2-212ENST00000531172 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.82■■■■■ 4.77
NUCB2-212ENST00000531172 WIZO95785 1651 aa44.68■■■■■ 4.74
NUCB2-212ENST00000531172 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.6■■■■■ 4.73
NUCB2-212ENST00000531172 WDR62O43379 1518 aa44.41■■■■■ 4.7
NUCB2-212ENST00000531172 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.4■■■■■ 4.7
NUCB2-212ENST00000531172 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.31■■■■■ 4.68
NUCB2-212ENST00000531172 TRIM41Q8WV44 630 aa44.27■■■■■ 4.68
NUCB2-212ENST00000531172 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.23■■■■■ 4.67
NUCB2-212ENST00000531172 CFTRP13569 1480 aa44.19■■■■■ 4.66
NUCB2-212ENST00000531172 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.12■■■■■ 4.65
NUCB2-212ENST00000531172 OSCARQ8IYS5 282 aa43.93■■■■■ 4.62
NUCB2-212ENST00000531172 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.88■■■■■ 4.61
NUCB2-212ENST00000531172 PRDM2Q13029 1718 aa43.66■■■■■ 4.58
NUCB2-212ENST00000531172 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.65■■■■■ 4.58
NUCB2-212ENST00000531172 IFT140Q96RY7 1462 aa43.51■■■■■ 4.56
NUCB2-212ENST00000531172 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.4■■■■■ 4.54
NUCB2-212ENST00000531172 TOPBP1Q92547 1522 aa43.39■■■■■ 4.54
NUCB2-212ENST00000531172 ABCC8Q09428 1581 aa43.38■■■■■ 4.54
NUCB2-212ENST00000531172 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.21■■■■■ 4.51
NUCB2-212ENST00000531172 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.19■■■■■ 4.5
NUCB2-212ENST00000531172 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.19■■■■■ 4.5
NUCB2-212ENST00000531172 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.19■■■■■ 4.5
NUCB2-212ENST00000531172 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.13■■■■■ 4.5
NUCB2-212ENST00000531172 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.05■■■■■ 4.48
NUCB2-212ENST00000531172 ARHGEF11O15085 1522 aa43.04■■■■■ 4.48
NUCB2-212ENST00000531172 FBLN2P98095 1184 aa43.04■■■■■ 4.48
NUCB2-212ENST00000531172 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.95■■■■■ 4.47
NUCB2-212ENST00000531172 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.93■■■■■ 4.46
NUCB2-212ENST00000531172 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.93■■■■■ 4.46
NUCB2-212ENST00000531172 CHD1O14646 1710 aa42.85■■■■■ 4.45
NUCB2-212ENST00000531172 SOGA1O94964 1423 aa42.84■■■■■ 4.45
NUCB2-212ENST00000531172 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.81■■■■■ 4.44
NUCB2-212ENST00000531172 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.78■■■■■ 4.44
NUCB2-212ENST00000531172 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.65■■■■■ 4.42
NUCB2-212ENST00000531172 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.65■■■■■ 4.42
NUCB2-212ENST00000531172 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.64■■■■■ 4.42
NUCB2-212ENST00000531172 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.59■■■■■ 4.41
NUCB2-212ENST00000531172 ARAP1Q96P48 1450 aa42.58■■■■■ 4.41
NUCB2-212ENST00000531172 WDR97A6NE52 1622 aa42.56■■■■■ 4.4
NUCB2-212ENST00000531172 CUX1P39880 1505 aa42.51■■■■■ 4.4
NUCB2-212ENST00000531172 GRIN2BQ13224 1484 aa42.46■■■■■ 4.39
NUCB2-212ENST00000531172 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.46■■■■■ 4.39
NUCB2-212ENST00000531172 SYNJ1O43426 1573 aa42.42■■■■■ 4.38
NUCB2-212ENST00000531172 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.34■■■■■ 4.37
NUCB2-212ENST00000531172 SYNJ2O15056 1496 aa42.33■■■■■ 4.37
NUCB2-212ENST00000531172 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.32■■■■■ 4.37
NUCB2-212ENST00000531172 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.28■■■■■ 4.36
NUCB2-212ENST00000531172 PBRM1Q86U86 1689 aa42.18■■■■■ 4.34
NUCB2-212ENST00000531172 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.13■■■■■ 4.33
NUCB2-212ENST00000531172 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.02■■■■■ 4.32
NUCB2-212ENST00000531172 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.02■■■■■ 4.32
NUCB2-212ENST00000531172 GRIN2AQ12879 1464 aa41.87■■■■■ 4.29
NUCB2-212ENST00000531172 TOP2BQ02880 1626 aa41.77■■■■■ 4.28
NUCB2-212ENST00000531172 ADAMTS12P58397 1594 aa41.76■■■■■ 4.27
NUCB2-212ENST00000531172 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.73■■■■■ 4.27
NUCB2-212ENST00000531172 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.73■■■■■ 4.27
NUCB2-212ENST00000531172 NUP160Q12769 1436 aa41.69■■■■■ 4.27
NUCB2-212ENST00000531172 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.68■■■■■ 4.26
NUCB2-212ENST00000531172 CEP170Q5SW79 1584 aa41.67■■■■■ 4.26
NUCB2-212ENST00000531172 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.65■■■■■ 4.26
NUCB2-212ENST00000531172 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.61■■■■■ 4.25
NUCB2-212ENST00000531172 SHROOM2Q13796 1616 aa41.48■■■■■ 4.23
NUCB2-212ENST00000531172 JPH4Q96JJ6 628 aa41.44■■■■■ 4.22
NUCB2-212ENST00000531172 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.44■■■■■ 4.22
NUCB2-212ENST00000531172 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.29■■■■■ 4.2
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