Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.212e-7■■■■■ 36.2
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SF3B4Q15427 RBM6-205ENST00000425608 1886 ntTSL 217.41■□□□□ 0.388e-8■■■■■ 36.1
SF3B4Q15427 ZNF207-201ENST00000321233 2283 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.862e-7■■■■■ 36.1
SF3B4Q15427 ZNF207-207ENST00000577908 4672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.022e-7■■■■■ 36.1
SF3B4Q15427 ZNF207-204ENST00000394673 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.092e-7■■■■■ 36.1
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SF3B4Q15427 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.62e-7■■■■■ 36.1
SF3B4Q15427 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.515e-8■■■■■ 36.1
SF3B4Q15427 EXOC3L4-207ENST00000560925 2341 ntTSL 222.02■■□□□ 1.125e-8■■■■■ 36.1
SF3B4Q15427 EXOC3L4-203ENST00000559661 665 ntTSL 516.31■□□□□ 0.22e-8■■■■■ 36.1
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SF3B4Q15427 SYNJ2-206ENST00000485863 810 ntTSL 317.06■□□□□ 0.321e-10■■■■■ 36.1
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SF3B4Q15427 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.062e-7■■■■■ 36.1
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SF3B4Q15427 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 36.1
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SF3B4Q15427 TSC2-206ENST00000439117 5073 ntTSL 1 (best)14.22□□□□□ -0.132e-7■■■■■ 36.1
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SF3B4Q15427 PSMA4-218ENST00000560099 2596 ntTSL 219.42■□□□□ 0.76e-12■■■■■ 36.1
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SF3B4Q15427 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.846e-12■■■■■ 36.1
SF3B4Q15427 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.946e-12■■■■■ 36.1
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SF3B4Q15427 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.091e-8■■■■■ 36
SF3B4Q15427 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11e-8■■■■■ 36
SF3B4Q15427 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.231e-8■■■■■ 36
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SF3B4Q15427 KIAA0319L-202ENST00000373266 2377 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.61e-8■■■■■ 36
SF3B4Q15427 KIAA0319L-203ENST00000426982 3213 ntTSL 511.16□□□□□ -0.621e-8■■■■■ 36
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SF3B4Q15427 RENBP-209ENST00000471056 398 ntTSL 511.26□□□□□ -0.611e-8■■■■■ 36
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SF3B4Q15427 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.161e-6■■■■■ 36
SF3B4Q15427 BTBD19-207ENST00000485668 2659 ntTSL 221.42■■□□□ 1.021e-6■■■■■ 36
SF3B4Q15427 AP1G2-222ENST00000556152 673 ntTSL 39.51□□□□□ -0.892e-13■■■■■ 36
SF3B4Q15427 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.595e-7■■■■■ 36
SF3B4Q15427 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.295e-7■■■■■ 36
SF3B4Q15427 CPSF7-209ENST00000463244 545 ntTSL 419■□□□□ 0.639e-11■■■■■ 36
SF3B4Q15427 CPSF7-210ENST00000474684 635 ntTSL 35.3□□□□□ -1.569e-11■■■■■ 36
SF3B4Q15427 TSTA3-203ENST00000525274 671 ntTSL 322.57■■□□□ 1.24e-7■■■■■ 36
SF3B4Q15427 TSTA3-204ENST00000526290 488 ntTSL 315.32■□□□□ 0.044e-7■■■■■ 36
SF3B4Q15427 TSTA3-206ENST00000527549 575 ntTSL 214.17□□□□□ -0.144e-7■■■■■ 36
SF3B4Q15427 TSTA3-216ENST00000533817 871 ntTSL 313.37□□□□□ -0.274e-7■■■■■ 36
SF3B4Q15427 TSTA3-205ENST00000527006 412 ntTSL 312.97□□□□□ -0.334e-7■■■■■ 36
SF3B4Q15427 TSTA3-212ENST00000530474 823 ntTSL 511.96□□□□□ -0.494e-7■■■■■ 36
SF3B4Q15427 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.955e-8■■■■■ 36
SF3B4Q15427 DRAM2-208ENST00000484310 1872 ntTSL 1 (best)20.88■□□□□ 0.935e-8■■■■■ 36
SF3B4Q15427 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.795e-8■■■■■ 36
SF3B4Q15427 SLC11A2-221ENST00000550329 622 ntTSL 218.04■□□□□ 0.483e-15■■■■■ 36
SF3B4Q15427 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.58e-8■■■■■ 36
SF3B4Q15427 DRAM2-203ENST00000462092 802 ntTSL 211□□□□□ -0.655e-8■■■■■ 36
SF3B4Q15427 SLC11A2-214ENST00000548150 530 ntTSL 410.52□□□□□ -0.733e-15■■■■■ 36
SF3B4Q15427 DRAM2-204ENST00000463682 688 ntTSL 38.05□□□□□ -1.125e-8■■■■■ 36
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