RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527006.1

TSTA3-205, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 3

Gene TSTA3, Length 412 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-205ENST00000527006 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.45■■■□□ 2.95
TSTA3-205ENST00000527006 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.49■■■□□ 2.31
TSTA3-205ENST00000527006 ABCC9O60706 1549 aa28.3■■■□□ 2.12
TSTA3-205ENST00000527006 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
TSTA3-205ENST00000527006 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.87■■■□□ 2.05
TSTA3-205ENST00000527006 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.74■■■□□ 2.03
TSTA3-205ENST00000527006 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.67■■■□□ 2.02
TSTA3-205ENST00000527006 NACADO15069 1562 aa27.65■■■□□ 2.02
TSTA3-205ENST00000527006 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.54■■■□□ 2
TSTA3-205ENST00000527006 SCRIBQ14160 1630 aa26.9■■□□□ 1.9
TSTA3-205ENST00000527006 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.75■■□□□ 1.87
TSTA3-205ENST00000527006 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.74■■□□□ 1.87
TSTA3-205ENST00000527006 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.58■■□□□ 1.85
TSTA3-205ENST00000527006 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.54■■□□□ 1.84
TSTA3-205ENST00000527006 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
TSTA3-205ENST00000527006 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.92■■□□□ 1.74
TSTA3-205ENST00000527006 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
TSTA3-205ENST00000527006 SMARCA4P51532 1647 aa25.8■■□□□ 1.72
TSTA3-205ENST00000527006 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.73■■□□□ 1.71
TSTA3-205ENST00000527006 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
TSTA3-205ENST00000527006 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.61■■□□□ 1.69
TSTA3-205ENST00000527006 SMARCA2P51531 1590 aa25.61■■□□□ 1.69
TSTA3-205ENST00000527006 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
TSTA3-205ENST00000527006 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.56■■□□□ 1.68
TSTA3-205ENST00000527006 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.55■■□□□ 1.68
TSTA3-205ENST00000527006 NCAPD3P42695 1498 aa25.49■■□□□ 1.67
TSTA3-205ENST00000527006 WIZO95785 1651 aa25.48■■□□□ 1.67
TSTA3-205ENST00000527006 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
TSTA3-205ENST00000527006 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.41■■□□□ 1.66
TSTA3-205ENST00000527006 HMGXB3Q12766 1538 aa25.38■■□□□ 1.65
TSTA3-205ENST00000527006 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
TSTA3-205ENST00000527006 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.01■■□□□ 1.59
TSTA3-205ENST00000527006 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.8■■□□□ 1.56
TSTA3-205ENST00000527006 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.73■■□□□ 1.55
TSTA3-205ENST00000527006 CFTRP13569 1480 aa24.73■■□□□ 1.55
TSTA3-205ENST00000527006 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.62■■□□□ 1.53
TSTA3-205ENST00000527006 NESP48681 1621 aa24.6■■□□□ 1.53
TSTA3-205ENST00000527006 PRDM2Q13029 1718 aa24.53■■□□□ 1.52
TSTA3-205ENST00000527006 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.48■■□□□ 1.51
TSTA3-205ENST00000527006 ERCC6Q03468 1493 aa24.45■■□□□ 1.5
TSTA3-205ENST00000527006 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.42■■□□□ 1.5
TSTA3-205ENST00000527006 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.31■■□□□ 1.48
TSTA3-205ENST00000527006 ABCC8Q09428 1581 aa24.3■■□□□ 1.48
TSTA3-205ENST00000527006 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.26■■□□□ 1.47
TSTA3-205ENST00000527006 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.26■■□□□ 1.47
TSTA3-205ENST00000527006 TRIM41Q8WV44 630 aa24.19■■□□□ 1.46
TSTA3-205ENST00000527006 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.16■■□□□ 1.46
TSTA3-205ENST00000527006 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.15■■□□□ 1.46
TSTA3-205ENST00000527006 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
TSTA3-205ENST00000527006 TOPBP1Q92547 1522 aa24.13■■□□□ 1.45
TSTA3-205ENST00000527006 CUX1P39880 1505 aa24.11■■□□□ 1.45
TSTA3-205ENST00000527006 WDR62O43379 1518 aa24.1■■□□□ 1.45
TSTA3-205ENST00000527006 TOP2BQ02880 1626 aa24.1■■□□□ 1.45
TSTA3-205ENST00000527006 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
TSTA3-205ENST00000527006 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.06■■□□□ 1.44
TSTA3-205ENST00000527006 SYNJ1O43426 1573 aa24.05■■□□□ 1.44
TSTA3-205ENST00000527006 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.98■■□□□ 1.43
TSTA3-205ENST00000527006 CUX2O14529 1486 aa23.96■■□□□ 1.43
TSTA3-205ENST00000527006 SOGA1O94964 1423 aa23.95■■□□□ 1.42
TSTA3-205ENST00000527006 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
TSTA3-205ENST00000527006 IFT140Q96RY7 1462 aa23.9■■□□□ 1.42
TSTA3-205ENST00000527006 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.82■■□□□ 1.4
TSTA3-205ENST00000527006 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.8■■□□□ 1.4
TSTA3-205ENST00000527006 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
TSTA3-205ENST00000527006 KIF27Q86VH2 1401 aa23.76■■□□□ 1.39
TSTA3-205ENST00000527006 WDR97A6NE52 1622 aa23.73■■□□□ 1.39
TSTA3-205ENST00000527006 EEA1Q15075 1411 aa23.73■■□□□ 1.39
TSTA3-205ENST00000527006 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
TSTA3-205ENST00000527006 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.66■■□□□ 1.38
TSTA3-205ENST00000527006 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
TSTA3-205ENST00000527006 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.62■■□□□ 1.37
TSTA3-205ENST00000527006 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.6■■□□□ 1.37
TSTA3-205ENST00000527006 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
TSTA3-205ENST00000527006 GRIN2BQ13224 1484 aa23.59■■□□□ 1.37
TSTA3-205ENST00000527006 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.59■■□□□ 1.37
TSTA3-205ENST00000527006 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
TSTA3-205ENST00000527006 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.55■■□□□ 1.36
TSTA3-205ENST00000527006 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.55■■□□□ 1.36
TSTA3-205ENST00000527006 IGF1RP08069 1367 aa23.53■■□□□ 1.36
TSTA3-205ENST00000527006 PBRM1Q86U86 1689 aa23.48■■□□□ 1.35
TSTA3-205ENST00000527006 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
TSTA3-205ENST00000527006 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.45■■□□□ 1.34
TSTA3-205ENST00000527006 CUL7Q14999 1698 aa23.44■■□□□ 1.34
TSTA3-205ENST00000527006 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.42■■□□□ 1.34
TSTA3-205ENST00000527006 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.42■■□□□ 1.34
TSTA3-205ENST00000527006 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
TSTA3-205ENST00000527006 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.36■■□□□ 1.33
TSTA3-205ENST00000527006 FBLN2P98095 1184 aa23.36■■□□□ 1.33
TSTA3-205ENST00000527006 PRXQ9BXM0 1461 aa23.36■■□□□ 1.33
TSTA3-205ENST00000527006 SYNJ2O15056 1496 aa23.35■■□□□ 1.33
TSTA3-205ENST00000527006 ADAMTS12P58397 1594 aa23.33■■□□□ 1.33
TSTA3-205ENST00000527006 KIF21BO75037 1637 aa23.3■■□□□ 1.32
TSTA3-205ENST00000527006 GOLGA3Q08378 1498 aa23.27■■□□□ 1.32
TSTA3-205ENST00000527006 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
TSTA3-205ENST00000527006 GRIN2AQ12879 1464 aa23.24■■□□□ 1.31
TSTA3-205ENST00000527006 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.2■■□□□ 1.3
TSTA3-205ENST00000527006 OSCARQ8IYS5 282 aa23.16■■□□□ 1.3
TSTA3-205ENST00000527006 CHD1O14646 1710 aa23.15■■□□□ 1.3
TSTA3-205ENST00000527006 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.14■■□□□ 1.29
TSTA3-205ENST00000527006 NUP160Q12769 1436 aa23.1■■□□□ 1.29
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