RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533817.5

TSTA3-216, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 3

Gene TSTA3, Length 871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-216ENST00000533817 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.01■■■■□ 3.36
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TSTA3-216ENST00000533817 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.02■■■□□ 2.4
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TSTA3-216ENST00000533817 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.91■■■□□ 2.38
TSTA3-216ENST00000533817 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.9■■■□□ 2.38
TSTA3-216ENST00000533817 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.81■■■□□ 2.36
TSTA3-216ENST00000533817 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.4■■■□□ 2.3
TSTA3-216ENST00000533817 SCRIBQ14160 1630 aa29.17■■■□□ 2.26
TSTA3-216ENST00000533817 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.15■■■□□ 2.26
TSTA3-216ENST00000533817 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.09■■■□□ 2.256e-9■□□□□ 10.6
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TSTA3-216ENST00000533817 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.19■■■□□ 2.1
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TSTA3-216ENST00000533817 SMARCA2P51531 1590 aa27.69■■■□□ 2.02
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TSTA3-216ENST00000533817 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.67■■■□□ 2.02
TSTA3-216ENST00000533817 HMGXB3Q12766 1538 aa27.58■■■□□ 2.01
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TSTA3-216ENST00000533817 NESP48681 1621 aa27■■□□□ 1.91
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TSTA3-216ENST00000533817 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.7■■□□□ 1.87
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TSTA3-216ENST00000533817 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.53■■□□□ 1.84
TSTA3-216ENST00000533817 CUX2O14529 1486 aa26.51■■□□□ 1.83
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TSTA3-216ENST00000533817 WDR62O43379 1518 aa26.4■■□□□ 1.82
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TSTA3-216ENST00000533817 TOPBP1Q92547 1522 aa26.18■■□□□ 1.78
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TSTA3-216ENST00000533817 ABCC8Q09428 1581 aa26.15■■□□□ 1.78
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TSTA3-216ENST00000533817 WDR97A6NE52 1622 aa25.74■■□□□ 1.71
TSTA3-216ENST00000533817 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.71■■□□□ 1.714e-8■■■■■ 34.1
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TSTA3-216ENST00000533817 PBRM1Q86U86 1689 aa25.52■■□□□ 1.68
TSTA3-216ENST00000533817 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.52■■□□□ 1.68
TSTA3-216ENST00000533817 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.49■■□□□ 1.67
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TSTA3-216ENST00000533817 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.37■■□□□ 1.65
TSTA3-216ENST00000533817 SYNJ2O15056 1496 aa25.35■■□□□ 1.65
TSTA3-216ENST00000533817 ADAMTS12P58397 1594 aa25.33■■□□□ 1.65
TSTA3-216ENST00000533817 KIF27Q86VH2 1401 aa25.32■■□□□ 1.64
TSTA3-216ENST00000533817 FBLN2P98095 1184 aa25.31■■□□□ 1.64
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TSTA3-216ENST00000533817 GRIN2AQ12879 1464 aa25.21■■□□□ 1.63
TSTA3-216ENST00000533817 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.17■■□□□ 1.62
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TSTA3-216ENST00000533817 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.11■■□□□ 1.61
TSTA3-216ENST00000533817 NUP160Q12769 1436 aa25.11■■□□□ 1.61
TSTA3-216ENST00000533817 CEP170Q5SW79 1584 aa25.1■■□□□ 1.61
TSTA3-216ENST00000533817 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.05■■□□□ 1.6
TSTA3-216ENST00000533817 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.04■■□□□ 1.6
TSTA3-216ENST00000533817 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.04■■□□□ 1.6
TSTA3-216ENST00000533817 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.04■■□□□ 1.6
TSTA3-216ENST00000533817 ARHGEF11O15085 1522 aa25.03■■□□□ 1.6
TSTA3-216ENST00000533817 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.93■■□□□ 1.58
TSTA3-216ENST00000533817 SHROOM2Q13796 1616 aa24.93■■□□□ 1.58
TSTA3-216ENST00000533817 EEA1Q15075 1411 aa24.92■■□□□ 1.58
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